蒋介石 59岁的时候，一面是国民党中央组织部长朱家骅发动全国党员为总裁 60寿辰大庆献九鼎，募捐建中正图书馆、中正体育馆、中正医院等等；还有看不见的一面，因蒋老朽昏庸，一批国民党内以何应钦为首的青年军官企图发动“宫廷政变”，还有忠实于他的黄埔子弟、以枪杆子为实权的胡宗南、戴笠、汤恩伯组成非常状态下的接班三人组合。这就是陪都时期，蒋介石 60岁的前夕，在国民党内部的“夺权”和“接班”潜在活动。
其实老谋深算的蒋介石，早在众人不太注意的时候就在扶持他的接班人。蒋经国在苏联曾公开抨击甚至谩骂蒋介石，还声称要脱离父子关系等等，他回到中国后，传说老蒋软禁小蒋，实际则是“闭门读书”“反省思过”。老蒋还物色了一位留美学者，即熟读孔孟经书的徐道邻作为小蒋的“专门教师”。老蒋对小蒋说：“徐老师是当今名士，博学多才，古文底子厚实，且又在英美留学多年。”蒋介石还特别指定《曾国藩家书》为必读书籍。
上海“八？一三”事件，老蒋接到溪口小蒋的信：“中原板荡，志士归心，国家民族已临生死存亡时刻，儿子决心为国出力，即使条件最坏，也可以试试自己的身心和勇气。”小蒋要参加工作，消息传出，有几位深懂老蒋用意的大员表示由他们出面安排。
老蒋深思熟虑后，同意了江西省主席熊式辉的意见，在江西划一个区域让小蒋施展才华。老蒋嘱咐熊：“要让他从基层干起。”还有“切切”二字。小蒋到了江西，熊只安排他一个“省保安处副处长”兼“江西省政治学院”学生总队长，后来升他为伤兵管理处处长，不久升江西保安司令部新兵处少将处长。
蒋经国果然没有“太子”架子，一套苏联工人爱穿的茄克和鸭舌帽，上班时间与士兵生活在一起，同住，同吃，同学习。业余时间，巡视市区，与群众打成一片。这些做法，与国民党原来一些军政骨干完全不同。在街上看见欺侮百姓的事，他义不容辞主持公道。这些做法引起人们对他的好感。他对新兵的待遇很关心，纪律严格，如违犯则予严惩。
很快，熊主席又任他为第四行政区专员，这时他只有 30岁。老蒋对儿子说：“毛泽东在地瘠民穷的延安，弄得天下驰名，赣南物产丰富，地广民众，你要是搞不出名堂就不是我的儿子。”这是小蒋到江西后第一次去重庆，老蒋对他的要求和希望。回专区后，小蒋提出建设新赣南。在熊式辉全力支持下，对新赣南的建设作出了一些成绩，这些悉数汇报到老蒋那里，老蒋此时为自己接班人作出了决定。不久，仅仅是一个三青团赣州分团干事长的蒋经国，立即上升为三青团江西省支团部干事长，从基层干起的升降机升得太快了，在不知不觉毫不惹人眼中，小蒋已是省一级支团部干事长了。因此在三青团第一次代表大会上，蒋经国以代表团长带队江西省代表团到重庆，返回江西后，又升为省政府委员，如火箭似的上升，为他以后进入陪都奠定了基础。
蒋经国的表现令江西人民满意。人说：“在苏联留学，他是带着国民党本质的共产党员；现在是有共产党人气质的国民党官员。”实际他把苏联学习的一套来为国民党统治办事，所以受老百姓欢迎。还是他的学生江南说得对：“蒋在赣南的新政，热闹有余，成事不足。”按照蒋介石的意图，蒋经国以三青团江西省支团干事长和江西省省府委员这两个身份，于 1944年调至陪都。
早在抗战前，蒋介石搞的秘密团体复兴社，其中著名十三太保中，抗战中真正成为左右要员只有康泽和戴笠。康泽是复兴社书记长，以后担任三青团组织处长。他先后在武汉和重庆办了几次“青干班”，加上他原来在庐山星子和重庆合川办的特训班，所培训的学员大多在重庆工作，少部分去了成都。蒋到成都办峨眉山训练团，康在蒋鞍前马后担任保卫工作，出生入死，曾在成都遭到川军暗杀，几遭身亡。重庆成为陪都后，康着手组织保甲，发展团员，为巩固政权立下汗马功劳。他死心踏地为蒋效力，万万没有想到，一张纸条撤销了他一切职务，派他到美国考察。蒋经国的副手胡轨代理了康的组织处长，立即成立三青团中央干部学校。老蒋兼校长，蒋经国为教育长，胡轨为副教育长实际负责。中央干校设研究班，把康泽原办的几期学员，当时多为三青团主要骨干，如组织处工作人员，重庆、四川及各省市等支团部书记、分团干事长，经过一训，都成为小蒋的骨干了。
胡轨，湖南人，黄埔二期学员， 30年代初，蒋保送他到德国学习，回国后，派到小蒋身边作为陪读。小蒋虽尊他为老师，实际一直作小蒋副手，江西如此，到了重庆也是如此。胡随小蒋至重庆，就由团长下条子派胡任三青团组织处副处长，后代处长。康泽离渝出国后，他的人马全转到小蒋名下了。到了美国有人转告他：老将希望你在美国、英国考察三年。明眼人很清楚，老蒋要用三年时间，让小蒋完全掌握三青团。
小蒋除了在中央干校任教育长外，又把中央团部组织处与训练处合并为组训处，由他本人任处长，胡轨为副处长。三青团从中央到地方班子不换人，只是用干校训练班重行教育一次，就变成拥护小蒋的力量。不用很多时间，一个新的派系在老蒋卵翼下形成，人们称其为“新太子系”。因为当时国民党中有个“太子系”，是指孙中山的儿子孙科，因他搞了个“中山学社”，组织了一批力量形成了政治团体。所以对小蒋这股政治力量称为“新太子系”。小蒋也的确效仿孙科，也办了一个“中正学社”，以研究蒋介石政治思想的学社，这也是小蒋半公开的核心组织。这个核心组织决定对外（指三青团之外）扩张，首先派出“中正学社”大将杨绰庵出任陪都重庆市政府的秘书长，这颇使舆论惊讶。有为杨大作宣传的，说杨原为一个邮政局检信员，由于自学成才，通过高考当上江西省民政厅长；也有影射“新太子系”手伸得太长的。对这件事蒋介石也认为“不能锋芒太露，打乱布置”，所以干了十个月就把杨调离，抗日胜利后杨为福州市长（杨为福建人）。
“新太子系”的发展是在蒋介石发动“十万知识青年从军运动”之后。为了号召国民党、政、军要人都送子从军，蒋介石也送蒋经国、蒋纬国从军。老百姓送子从军只是当兵，蒋送子从军是为了掌权。运动宣传得十分火热。为了造声势，蒋介石选了几个干练的现役军长，压一级来当青年军的师长，目的是提高青年军的地位，由蒋军队中亲信陈诚（后在台北当过副总统）推荐广东人罗卓英为“训练总监”，总监的政治部主任竟然是蒋经国。“新太子系”进一步扩张起来，不仅掌握了三青团，插手行政，进而发展到掌握青年军。一些被蒋介石豢养起的元老们已经清楚了，蒋介石培养小蒋接他的班了。