由于时任造币厂总监托马斯·尼尔认为自己的工作是一份闲差，对工作并不热心，整天出入赌场和酒店，牛顿成了造币厂事实上的负责人。牛顿建议召回旧币，铸造新币。在财政部的花园后面，牛顿建起了10座大熔炉，用来熔化召回的旧币。铸造熔炉对牛顿来说已经不是什么难事了。他早在多年前就曾自己动手建过一座用来炼金的熔炉，因此，在这项工作上，牛顿表现得非常出色。在他的指挥下，工人们很快就建起了10座坚固的熔炉。
熔炉下燃起了熊熊大火，熔炉里的旧币渐渐熔化……牛顿的脸被大火烤得通红，豆大的汗珠往下掉，但他依然十分兴奋。眼前的情景跟他在实验室里进行的炼金活动多么相似啊！所不同的是，炼金活动是秘密进行的，而且是想把普通的金属炼成黄金；熔化旧币则是公开进行的，所得到的全是名副其实的贵金属。
旧币熔化之后，牛顿便命人将所得的贵金属送往伦敦塔。在那里，崭新的货币将会重新铸造出来。造币厂越有500名工人，分作两班，每班工作10小时，每周工作6天。为了提高工作效率，牛顿对整个铸币流程进行了细致的研究。他干得很卖力，就像当年进行科学研究一样，几乎达到了废寝忘食的地步。
在牛顿的督导下，工人们加班加点地工作着，新币的产量迅速提升。在牛顿到任后的几个月，新币的产量就提高了8倍，每周可生产5万千克，市场上新币短缺的情况很快就得到了缓解。不过，他们离币制改革所要达到的目的还有一段距离。
在币制改革进行之时，一些不法商贩千方百计地提高金属原料的价格，大发国难财，这让牛顿出类拔萃的运算能力自然而然地成了无价之宝。当时用于铸造货币的材料大多是较为廉价的铜银合金或铜金合金。根据铜、银和金等金属的市场价格以及铸造合金的成本，牛顿计算出每磅（约合0.454千克）合金的价格为7.5便士。但当时皇家造币厂购买金属原料之时，其价格远远超过了7.5便士。
有一次，一个大商人声称要以低价向造币厂供应合金原料。牛顿得到消息后，立即派人将商人请到办公室，直接与其接洽。一见面，牛顿就要求商人报价。
商人恭维牛顿说：
“艾萨克·牛顿先生，您可是全英国最伟大的科学家，在您的面前，我们可不敢耍花样。”
“你直接报价就可以了！”牛顿冷冷地说。
商人狡猾地说：
“牛顿先生，看在您的面子上，我就报一个最低价，每磅12.5便士。”
牛顿瞥了商人一眼，轻描淡写地说：
“12.5便士？这个价格是怎么定的呢？”
商人回答说：
“这可是最低价格了，是根据铜、银、金的价格以及铸造合金的成本核算出来的。”
牛顿“哼”了一声，追问道：
“是吗？那么你能在我面前再演算一遍吗？”
商人知道，在牛顿面前进行数学运算简直就是自讨没趣，他只好继续撒谎道：
“牛顿先生，这个价格确实是根据成本核算出来的。不过，在您这位伟大的数学家面前，我可不敢运用数学。”
牛顿笑了笑，提起笔在稿纸上运算起来。他一边运算，一边对商人说：
“听着，我已经算过价格，每磅定价7.5便士就可以保证你的利润了。如果你再敢哄抬价格，小心我上报给国王陛下，治你的死罪！”
商人一听牛顿这话，脸上红一阵白一阵，过了半晌才低声道：
“再也不敢了，再也不敢了，我的报价就定在7.5便士。请牛顿先生一定要高抬贵手，饶过我这一次吧！”
牛顿看着商人滑稽的表情，不禁微笑道：
“先生，你实在用不着这样！以后只要本本分分地给皇家造币厂供应原料，你肯定会赚大钱的！”
商人见牛顿并没有追究自己的欺瞒之罪，也放了心。从此，他便安安分分地给皇家造币厂供应合金原料。
就这样，牛顿到任几个月之后，不但新币的产量大增，成本也急剧降了下来。
（四）
牛顿在造币厂的另外一项重要工作，就是打击伪造硬币的不法分子。为了防止造假和修剪硬币，牛顿对新币的边缘进行了规定。但在利益的趋势下，仍有不少人处心积虑地研究新币的特点，照样伪造和修剪硬币。这不但给牛顿的工作带来了极大的麻烦，也严重地影响了英国的金融秩序。法律规定，凡是伪造货币者，一经发现，立即处死。但由于防伪技术落后，伪造货币简单易行，政府根本无力控制此种犯罪行为。
为了降低假币对金融市场的冲击，牛顿在提高产量和降低成本的同时，还加强了对犯罪分子的打击力度。令人难以置信的是，这位一直隐居在三一学院的学者居然摇身一变，成了频繁出入低级酒吧和妓院的侦探。
为了寻找犯罪分子，牛顿在低级酒吧和妓院里安插了许多眼线。每天下午，牛顿都会打扮成商人的模样，到低级酒吧和妓院去和那些眼线接头。一旦发现情况，他便会向他的密探发出命令，逮捕嫌疑人。
牛顿对待犯罪分子是极其冷酷的。据说，他曾在一周之内处决了10名伪造货币者。
有一次，牛顿安插在低级酒吧的眼线向他报告，再次发现了威廉姆·夏隆纳的踪迹。威廉姆·夏隆纳是一名穷凶极恶之人，他不但伪造了大量的货币，还杀过人。但由于此人极其聪明，官方一直没有找到他的犯罪证据。
聪明的牛顿想到了一个办法，他派一名眼线主动接近威廉姆·夏隆纳，假装与其一起伪造货币。经过一段时间的努力，牛顿终于找到了威廉姆·夏隆纳的犯罪证据，并下令逮捕了他。遗憾的是，由于看守在夜间睡着了，威廉姆·夏隆纳最终又越狱了。
几个月以来，牛顿和他的密探们一直在全力追查威廉姆·夏隆纳的踪迹，但每次在关键时刻都被他逃走了。这一次，牛顿打算不再兴师动众了。他命令两名侦探化装成商人，悄悄潜入那家低级酒吧，趁威廉姆·夏隆纳酒酣之际，出其不意地逮捕了他。
当威廉姆·夏隆纳再次被带到牛顿面前之时，牛顿横眉怒目地训斥道：
“小子，这下你完蛋了！看你还往哪跑！”
威廉姆·夏隆纳立即争辩道：
“你无权逮捕我，我根本就没有犯罪！”
牛顿“哼”了一声，大声训斥道：
“如果没有掌握你的犯罪证据，我又怎么会贸然命人逮捕你呢？你就等着法律的制裁吧！”
说完，牛顿向身边的人挥了挥手。两名密探会意，立即到档案室将威廉姆·夏隆纳的犯罪证据拿了出来。面对如山铁证，威廉姆·夏隆纳再也不敢狡辩了。
几天之后，威廉姆·夏隆纳便被处决了。
牛顿在处理这一案件中所表现出的机智和勇敢很快就在伦敦传开了。一些作家还以此为题材，创作了侦探小说。国王威廉三世也对牛顿的机智表现赞不绝口。
经过几年的努力，币制改革终于取得了显着的成效。1699年，造币厂总监托马斯·尼尔去世了，牛顿顺利成章地成为皇家造币厂的新任总监。
得到这个肥差之后，牛顿一向窘迫的经济条件才彻底有了改观。光是皇家造币厂总监一职，牛顿每年就可以得到2000英镑的薪资。这在当时可是一笔非常庞大的收入了。当时，英国政府建造格林威治天文台也不过耗资500英镑。牛顿一年的薪资收入就可以盖4座大楼了！此外，按照规定，牛顿还可以对造币厂铸造的每一枚硬币征收铸币税。
作为造币厂总监，牛顿是合格的、出色的，表现出了令人惊讶的行政组织能力。如果他从青年时期就开始从政的话，说不定会成为内阁大臣呢！但是，如此一来，人类就会失去一位天才科学家。英国并不缺乏造币厂总监，而牛顿只有一个。
牛顿在造币厂总监的位子上一坐就是26年，与他钻研科学的时间几乎相等。这对人类的科学事业而言，或许是一种损失，因为牛顿如果在这26年的时间里继续全心全力研究科学的话，可能会创造出更伟大的成就；但对牛顿个人而言，他有权选择自己的生活方式，无论是做科研学研究，还是当造币厂总监，一切都应该由他自己安排。