上海交大要重振雄风其中一个重大的困难，就是校园太小，校舍太少。由于校舍太少，虽然教职工人数多，学术造诣高，却难以发展了。这是上海交大历史上遗留下来的难题。建国以来，历任校长及其领导部门——教育部，六机部，国防科委都曾设法谋求解决，终因阻力太大，困难很多，而没有结果。
要扩建校舍，首先碰到的是经费问题，当年六机部下达的经费每年约2000万元。交大改革，百业待兴，这点钱真是杯水车薪，哪还有钱来征地扩大校园啊！
从传统观念出发，国家办的大学，在计划经济时代，经费只有向主管领导部门伸手，这是天经地义的事。要不到，不是国家有困难，就是主管部门有难处，学校领导向下双手一摊，也就没有责任了，这就是常说的：“上面给多少钱，我办多少事。”但是，邓旭初和交大领导班子可不是这种精神状态，当然向主管部门“要”，是绝不会放松的，还一定要千方百计想方设法来办成这个必须办成的大事。因为这是上海交大能否进一步发展的命根子啊！
邓旭初把很大的精力用于向上面争取多拨基建费上。经过多方努力，1980年国家计委同意给上海交大300万元基建专项补贴。但是否每年都给，则要看情况。学校每年都要去争取，不能有一点疏忽大意。
上海交大回归教育部领导后，教育部有关负责同志全面视察了交大校园。临走时，向学校领导指出：“上海交大校舍这样挤，如不解决，招研究生不具备条件。”邓旭初等学校领导听了，震动很大，扩大校园问题已拖不下去了。急需决策拍板。与此同时，北京传来消息，中央决定要在全国选择几所大学，列为重点建设。国家计委将另拨基建投资。
学校领导一致认为要力争列入重点建设项目，虽然还不清楚投资强度多大，反正学校得先上报项目。
扩建校园，选址是一个大问题，在原处扩建还是另行征地。就地扩建的好处是管理方便，学校内部阻力小。但是要取得学校周围的土地，200亩土地的动迁费用将近一亿元，周期至少要三年。而且一二百亩地也解决不了什么问题。在郊区征地，大家希望和徐汇校区近一点，曾在梅陇、莘庄、青浦看了不少地方，还去淀山湖畔看了一些地点，开始觉得那里环境也不错，但市规划部门概不同意。其实上海市领导和规划部门早已有明确的导向，希望交大在闵行建新校区，上海交大只好走这条路。
于是，一些人对选址闵行有意见，责备邓旭初为什么在那么远的地方办分校，干什么都不方便。邓旭初和交大领导班子表现得极其团结，对一些教师说：“这是学校党委决策，校教代会通过，上级批准，不存在个人决策。”要求大家不要天天纠缠争论“谁决策”，“民主不民主”，“对不对”这类问题。当时，不少教师又担心，新校区建成后，会不会将来与校本部分开独立成两所学校，这是因西安、上海两所交大的前车之鉴。讨论中，提出横向布局的办法，即把全部一、二年级放在闵行，相应理科类专业和系以及新建的专业和系放在闵行。这样，两个校区就不可能独立，这个建议为邓旭初首肯，党委和校领导一致通过，后来教代会也通过了。
1983年4月16日，学校正式向上海市政府上报了建设闵行新校区的报告；6月20日又向教育部报告。7月20日教育部正式批复：同意在闵行征地1500亩建设新校区。加上后来与电力部联合办学，闵行校区校园为1800亩。这可是邓旭初多少次奔波，多少次请示的结果啊！这时，上海交大已获准列为国家重点建设项目，为期5年，每年2000万元基建拨款。在此以后，征地面积和经费又有了追加和发展。
1983年9月2日，上海市召开市长办公会议，专题讨论审议交大建设闵行新校区问题。邓旭初派副书记陆中庸同志和范祖德参加会议。会后，市府办公厅为此发了一个书面的市长办公会议通报。这次会后市里各部门开绿灯，在原闵行区规划出一片“教育科研区”，准备吸引更多高校和科研单位。征地面积也超过了10个学生1亩地的标准，留了发展余地。特别是红线外的市政配套3500万元由市政府承担，不要交大付一元钱。市建委重大工程办公室下令各路市政保证交大闵行新校区1987年秋季按时开学。
走到“批准”这一步，邓旭初和上海交大有关领导尝尽了“千辛万苦”的滋味，虽没有“一把辛酸泪”，却也是“香从苦寒来”。
1986年7月，在闵行新征的农田上举行了新校区的开工典礼。当时任上海市委书记、市长的江泽民同志出席了开学典礼，作了重要讲话，并为母校题词：“百年大计，教育为本，努力把上海交大办成第一流大学。”倪天增副市长出席了开工典礼，他说：“虽说交大是扩建，实际上是建一所万人大学。”
新校区的建设启动了。1987年9月建成并迎来了第一批2600名新生，创造了上海交大建设史上的“闵行速度”。邓旭初在参加典礼时，喜泪盈睫。
闵行校区已于1987年初步建成，数学楼、物理楼、化学楼、电力楼、信控楼、建工楼、西区教学楼、东区教学楼、图书馆、实验楼群、大礼堂、学术活动中心、学生活动中心、体育馆、学生公寓楼群等近百幢大楼陆续在一片田野上拔地而起。漂亮的教学大楼，明亮的思源湖，宽大的体育场，勾勒出一幅幅美丽的风景画。校园内绿树成荫，大学生们在宽敞宏轩、环境优美、设施齐全的校园里读书，弦歌盈耳，欢乐何如！
邓旭初已经离开上海交大领导岗位，但他仍与广大师生一样为此而兴高采烈。但当时却听到骂声不绝：“都是邓旭初造的孽，让大家跑这么远去上课。住在偏僻的闵行，做什么都不方便，都是邓旭初搞的；邓旭初好大喜功，害得大家受苦受难……。”邓旭初对此只好充耳不闻，苦笑置之。
现在好了，邓旭初已不大听到“骂娘”声了，还传来了不少“赞扬”之声。
这是因为闵行校区对交大发展的作用越来越明显，随着市政基础设施的发展，师生们的生活不便等问题，正逐步改善之中。
现在，上海交大迎来了闵行校区发展的第二个春天。2002年，上海交大、闵行区人民政府及紫江集团联合共建闵行紫竹科技园，扩建交大闵行大学园区，新一轮的建设已经拉开序幕，新增闵行大学园区2800亩地的校区扩建工程已经进入全面规划实施阶段，闵行校区面积已达到5000亩。交大的办学中心也即将向闵行转移，闵行校区已经成了上海交大发展的新的希望所在。