例三：崇祯元年（１６２８）四月己亥，“孝和皇太后弟新城侯王升者……天启中为逆珰所陷构，捕族人王国兴等下狱论死，革升爵……。至是升讼冤，刑部会同驸马都尉、宗人府等衙门审其诬，复升爵，免国兴等死。”二吏部（一）吏部组织《大明会典》曰：“（吏部）尚书、左右侍郎，掌天下官吏，选授勋封考课之政令。其属初有四子部，曰总部，曰司封，曰司勋，曰考功。后改总部为选部，又改选部为文选，司封为验封，司勋为稽勋，考功仍旧，俱称清吏司。”吏部设“尚书一人，左右侍郎各一人……其属，文选、验封、稽勋、考功四清吏司，各郎中一人，1外郎一人，主事一人。”各司主事1额，各朝稍有增减，兹不赘述。
（二）吏部职掌（有关司法审判部分）
明代重大案件，皇帝常敕令公、侯、驸马、伯、五府、六部、九卿及科道会审。至于京师斩绞监候案件（即朝审案件），定制由三法司等衙门复核。吏部为六部之一，自得参与会审及复核。又吏部尚书、侍郎等官，亦得以其吏部官1个人之身分参与司法审判。
吏部官1个人参与司法审判之案例颇少，兹举一案例说明之：
永乐七年（１４０９）六月甲辰，“刑科右给事中耿通等劾：‘都察院左都御史陈瑛及监察御史袁纲、覃珩朋比蒙蔽，诬构善良，陷之死地。’……皇太子曰：
‘此冤狱也，吾初固已不信，必出法司锻炼。’命吏部尚书兼詹事蹇义，会六部大臣于詹事府审之。”
三户部（一）户部组织《大明会典》曰：‘（户部）尚书、左右侍郎，掌天下户口田粮之政令。其属初曰民部，曰度支部，曰金部，曰仓部。后改为十三清吏司，曰浙江、江西、湖广、福建、山东、山西、河南、陕西、四川、广东、广西、云南、贵州。”
户部设“尚书一人，左右侍郎各一人，其属浙江、江西、湖广、陕西、广东、山东、福建、河南、山西、四川、广西、贵州、云南十三清吏司，各郎中一人，1外郎一人，主事二人。”各司郎中、1外郎及主事1额，各朝稍有增减，兹不赘述。
（二）户部职掌（有关司法审判部分）
户部与各部参与司法审判之情形类似，即得参与重大案件之会审，及京师斩绞监候案件（即朝审案件）之复核。此外，户部掌理京师田土案件，与其他各部不同。
户部审理京师田土案件之情形，兹举下例案例说明之：
例一：正统元年（１４３６）三月己卯，“顺天府大兴县民地五十亩被行在锦衣卫指挥林观、千户朱喜占种，至是民妇诉，系故夫祖业，家道贫穷，乞赐给还。上命行在户部复实还之。”
例二：景泰四年（１４５３）十一月己未，“有讼户部侍郎李敏前为（顺天府）
府尹时，纵婿盗本府银四百余两。及巡抚直隶，又埋没苏、松等府钱粮数百余万两。诏户部、都察院其速委官往究。从之。”
户部官1个人参与司法审判之案例亦少，兹举下列案件说明之：
例一：正德二年（１５０７）冬十月辛卯，“魏国公徐甫与无锡县民邹塾等及妙相院僧争田。……上重命户部左侍郎王佐同大理寺右少卿王鼐，锦衣卫指挥佥事周贤往勘之。”
例二：万历十七年（１５８９）九月甲子，“法司当虑囚。上命户部尚书宋主笔，疏上，以改拟钦定人犯焦文烂诘责。不允。”
四礼部（一）礼部组织《大明会典》曰：“（礼部）尚书、左右侍郎，掌天下礼乐，祭祀、封建、朝贡、宴享、贡举之政令。其属初曰仪部，曰祠部，曰膳部，曰主客部。后改仪部为仪制，祠部为祠祭，膳部为精膳，主客仍旧，俱称清吏司。”礼部设“尚书一人，左、右侍郎各一人，其属……仪制、祠祭、主客、精膳四清吏司，各郎中一人，1外郎一人，主事一人。”各司主事1额，各朝稍有增减，兹不赘述。
（二）礼部职掌（有关司法审判部分）
礼部掌理礼制、宗教、教育及外交事务，礼部部分职掌与司法审判有关。
礼部与各部参与司法审判之情形类似，即得参与重大案件之会审，及京师斩绞监候案件（即朝审案件）之复核。此外，礼部得参与有关礼制等事项案件之司法审判，兹举下例案例说明之：
例一：弘治十八年（１５０５）十二月乙丑，“晋府庆成王南海郡君仪宾李实以包揽钱粮获罪，郡君私入京击鼓讼冤。礼部请遣中使送回，仍敕王约束，而究治教授、守城官罪。上以郡君出城诉讼，有乖礼法，命会法司议。……于是，礼部及法司议复奇滔等宜候勘报区处，仍申明禁例，凡越例私奏者，俱寝其事。”
例二：嘉靖四十年（１５６１）三月癸亥，“刑部左侍郎赵大佑、锦衣卫都指挥佥事万文明等复勘伊王典不法事得实，还报……疏入，诏下礼部、三法司会议，言：‘伊王奢纵淫虐，大违祖训，法当重处，请严加戒谕，令其速图自新。’”
例三：隆庆元年（１５６７）正月甲申，先是代王奏大同知县朱可进笞辱辅国将军俊柳，而抚按官张志孝、蒙诏又言，诸宗室殴伤可进。先帝命刑科右给事中严从简往勘。……事下，礼部、都察院以俊等犯在赦前，复请宽宥，而劾治诸校尉，充边卫军。从之。礼部官1个人参与司法审判之案例亦少，兹举下列案例说明之：
例一：永乐三年（１４０５）六月壬申，“高邮州民父年者，其长子不听教令，欲击之，而力不能制，夜以次子往助，长子竟毙于父。……命礼部尚书蹇义等再议。义等奏曰：‘次子从父命助执兄，初非杀兄之意，其罪但不能乞免，兄之死于父耳。’上命谪戍边，其父免赎。”
例二：嘉靖十三年（１５３４）十月乙未，“法司复礼部左侍郎黄绾勘明大同叛卒及文武诸臣罪状：叛卒玉宝、尚卿论凌迟处死；张斌、阚钺、萧激、牛名、董海、王仓、樊钦、许宝坐斩。……议上，报如议。”
五兵部（一）兵部组织《大明会典》曰：“（兵部）尚书、左右侍郎掌天下武卫官军选授、简练、镇戍、厩牧、邮传、舆皂之政令。其属初曰司马，曰职方，曰驾部，曰库部。后改司马为武选，驾部为车驾，库部为武库，职方仍旧，俱称清吏司。”
兵部设“尚书一人，左、右侍郎各一人，其属……武选、职方、车驾、武库四清吏司，各郎中一人，1外郎一人，主事二人。”各司郎中、1外郎及主事1额，各朝稍有增减，兹不赘述。
（二）兵部职掌（有关司法审判部分）
兵部与各部参与司法审判之情形类似，即得参与重大案件之会审，及京师斩绞监候案件（即朝审案件）之复核。此外，兵部得参与有关军人犯罪案件之司法审判，兹举下列案件说明之：
例一：宣德十年（１４３５）七月辛卯，“行在刑科给事中年富奏：‘都指挥吕整坐杀降死罪，屡自陈为都曹俭所诬。今总兵官都督方政奉俭怯懦贪黜，数违法。臣恐俭于整有衔，请贳整，令戴罪自劾，庶不致忠良者被枉。’上命兵部同都察院谳整狱以闻。”
例二：弘治十七年（１５０４）闰四月戊辰，朝廷追治贵州普安州败军之罪。
“礼科给事中张维新等按之，具得其罪状。于是，都察院、兵部会议，坐任礼、张英及李堂等一十人俱处斩。”
例三：嘉靖二十九年（１５５０）七月壬子，巡视浙福都御史“朱纨奏：‘海夷佛狼机人行劫至漳州界，官军迎击之，于走马溪生擒得贼首李光头等九十六人，已遵便宜斩首讫。’章下兵部，请俟复实论功，会御史陈九德疏论纨专杀，滥及不辜。法司复请遣官会勘。……于是，兵部、三法司再复，如汝祯等言。”
六工部（一）工部组织《大明会典》曰：“（工部）尚书、左右侍郎，掌天下百工营作、山泽、采捕、窑冶、屯种、榷税、河渠、织造之政令。其属初曰营部，曰虞部，曰水部，曰屯部。后改营部为营缮，虞部为虞衡，水部为都水，屯部为屯田。俱称清吏司。”
工部设“尚书一人，左、右侍郎各一人，其属……营缮、虞衡、都水、屯田四清吏司，各郎中一人，1外郎一人，主事二人。”各司郎中、1外郎及主事1额，历朝稍有增减，兹不赘述。
（二）工部职掌（有关司法审判部分）
工部与各部参与司法审判之情形类似，即得参与重大案件之会审，及京师斩绞监候案件（即朝审案件）之复核。
工部官1个人几无参与司法审判之案例，但涉及工部职掌之案件，工部得奏闻皇帝建议逮捕审讯，兹举一案例说明之：
正统三年（１４３８）六月丁己，“行在工部尚书吴中言：‘应天府上元、江宁二县民匠例应二年一番赴工，有自宣德七年休番，至今犹未赴工者一千六百余人，请敕有司逮系至京治罪。’从之。”
七通政使司（一）通政使司组织《大明会典》曰：“洪武三年，初置察言司，设司令，掌受四方章奏，寻革。
十年，始置通政使司，正三品衙门。设通政使、左右参议、经历、知事。职专出纳帝命、通达下情、关防诸司出入公文、奏报四方章奏、实封建言、陈情伸诉、及军情声息灾异等事。”
通政使司设“通政使一人，左右通政各一人，誊黄右通政一人，左、右参议各一人。”
（二）通政使司职掌（有关司法审判部分）
洪武十年（１３７７）秋七月甲申，置通政使司时，亦定其职掌曰：“掌出纳诸司文书、敷奏、封驳之事。”惟《诸司职掌》中通政使司已无封驳之权，封驳之权已移至六科。
明初，诸司文书只有奏本与启本，上皇帝者称为奏本，上东宫者称为启本。永乐以后，方有题本。题本与奏本的区别，《大明会典》曰：“凡内外各衙门，一应公事用题本，其虽系公事，而循例奏报、奏贺，若乞恩、认罪、徼敕、谢恩，并军民人等陈情、建言、申诉等事，具用奏本。”在外衙门之题本与奏本，以及在京衙门之奏本，由通政使司收本，奏闻皇帝。至于在京衙门之题本，则由各部院官1至会极门递本，由太监收本，奏闻皇帝。故《天府广记》
曰：“京朝官封事，自会极门内臣收进，其余自通政司入。”《万历野获编》亦曰：“今本章名色，为公事则曰题本，为他事则曰奏本。收本之处，在内曰会极门，在外则为通政司。”
明代直隶及各省司法审判机关审理刑名案件完结后，均应以题本送通政使司奏闻皇帝。至于在京司法审判机关审理刑名案件完结后，亦均应以题本至会极门递本，奏闻皇帝。有关司法审判案件题本之递本与收本，系明代中央司法审判程序之先行程序，虽非司法审判之核心部分，但仍系明代中央司法审判程序之重要环节。
在京军民词讼不得迳向法司递状，而应先向通政使司递状，再移送法司审理。《明世宗实录》嘉靖三十七年（１５５８）六月己卯日载：
刑部尚书郑晓等言：“故事，在京军民词讼俱赴通政司告，送法司问断。各衙门有应问者，参送法司，不得自决。比来事权不一，诸司各自受词，不复参送。……疏上。得旨：“自今在南京军民词讼，各衙门并巡城御史毋得迳自受理，违者奏治。”
通政使司与六部参与司法审判之情形类似，通政使为大九卿之一，“凡议大狱，必参预。”故通政使司得参与重大案件之会审，及京师斩绞监候案件（即朝审案件）之复核。
八六科（一）六科组织《大明会典》曰：“国初，设给事中，正五品。洪武四年，改正七品。六年，始分吏、户、礼、兵、刑、工六科，各设给事中一1，秩从七品，推年长者一人掌科事。寻隶承敕监，隶通政司。十三年，置谏院，设左右司谏各一人，左右正言二人，已改名元士，又曰4士，或增至八十一人。二十四年，始更定六科给事中品秩。……职专主封驳纠劾等事。”
明代六科，各自为一署，即六衙门也。六科“各都给事中一人，左、右给事中各一人，给事中，吏科四人，户科八人，礼科六人，兵科十人，刑科八人，工科四人。”万历年间，各科给事中1额稍有增减，兹不赘述。
（二）六科职掌（有关司法审判部分）
六科代表皇帝监督六部政务之施行。《明史·职官志》曰：“六科，掌侍从、规谏、补阙、拾遗、稽察六部百司之事。凡制敕宣行，大事复奏，小事署而颁之；有失，封还执奏。凡内外所上章疏下，分类抄出，参署付部，驳正其违误。”
六科给事中得劾奏文武官1。《大明会典》：“凡两京大臣方面等官，有不职者，俱得劾奏或大班面劾。及诸人有不公不法等事，俱得劾奏。”六科给事中劾奏文武官1后，皇帝常敕令锦衣卫或法司审讯被劾奏之官1。
都察院十三道监察御史与六科给事中合称“科道官”，科道官纠劾文武官1的职权是类似的。
六科与六部参与司法审判之情形类似，六科得参与重大案件之会审，及京师斩绞监候案件（即朝审案件）之复核。《大明会典》曰：“凡三法司奉旨于午门前鞫问罪囚，掌科道官亦预。”六科参与重大案件之会审，兹举例说明如下：
例一：永乐四年（１４０６）五月戊午，“先是，有告故驸马都尉富阳侯李让家人中盐虚买实收者，上命付锦衣卫鞫之。锦衣卫复奏告者不实，上命六科给事中孙琳等共审之”。
例二：正统十一年（１４４６）九月己巳，吏部尚书王直、右侍郎赵新、曹义、掌光禄寺事户部左侍郎奈亨等有罪案发，”上怒，逮直、亨等，命三法司、六科廷鞫之，论亨斩，直、义、新等赎徒，4赎杖，俱还职役。”
除上述参与司法审判之事项外，六科给事中另有下列事项与司法审判有关：
１受理登闻鼓案件洪武元年（１３６８）十二月己巳，“置登闻鼓于午门外，日令监察御史一人监之。凡民间词讼皆自下而上，或府、州、县省官及按察司不为伸理，及有冤抑重事不能自达者，许击登闻鼓，监察御史随即引奏，敢沮告者死。其户婚、田土诸细事皆归有司，不许击鼓。”后此项工作移至六科。
宣德二年（１４２７）六月丙子，“直登闻鼓给事中以所受词上闻。上因谕之曰：‘朝廷虚刑狱有冤，下情不能达，故设登闻鼓。然前代置院设官，托耳目于一人，非兼听广览之道。我国家命六科给事中轮直，最得其当。’”
关于六科受理登闻鼓案件，《大明会典》定曰：“凡登闻鼓楼，每日各科轮官一1。如有申诉冤枉，并陈告机密重情者，受状具题本封进。其诉状人先自残伤者，参奏。”
登闻鼓案件如奉旨钦依，应依一定程序由各科直鼓官批送法司。《大明会典》即曰：“凡击登闻鼓诉冤，奉钦依者，俱该锦衣卫直日官，将原给驾帖，填写5由，并人犯姓名。鼓下词状，从各科直鼓官批送。”
２受理京师重犯决囚日诉冤案件京师死罪立决或监候人犯执行死刑时，由六科给事中一1监视行刑。
有明一代有所谓“批手留人”之制，即京师决囚之日，死罪人犯家属临刑喊冤，监视行刑之给事中得批字于校尉之手，传令停决候旨。此即《大明会典》
所称“如决囚之日，有诉冤者，受状后，批校尉手，传令停决候旨。”《大明会典》又曰：“凡奉旨处决重囚，本卫（锦衣卫）从刑科给驾帖差官同法司监决。
其囚人家属或奏诉得旨姑留者，校尉从刑科批手，驰至市曹停刑。”
３奉旨参劾文武官1明代六科给事中本应自行参劾文武官1，但皇帝有时亦交议此类参劾案件，惟应视为特例，非常规常制也。兹举例说明如下：
例一：景泰三年（１４５２）八月己卯，“内官阮忠谮驸马都尉焦敬僭用镀金鞍、蟒龙服及收养迩军为奴，娼女为妾。诏六科十三道劾其罪，下法司议，赎杖还职，命固禁之。”
例二：天顺元年（１４５７）三月癸酉，“驸马都尉薛桓尝私侍婢，与常德长公主争，语犯上，事闻，命六科十三道劾桓罪，法司拷讯于外廷，论当斩。下锦衣卫狱，固禁数日，释之。”
例三：天顺五年（１４６２）六月戊寅，“安乡伯张宁早朝，越位与都督佥事赵辅语。六科十三道被旨劾之，下锦衣卫狱鞫，送都察院论，当赎杖还爵，上命送锦衣卫系之。”
（三）刑科职掌刑科为六科之一，除代表皇帝监督刑部政务（含司法审判）之施行外，对都察院及大理寺之司法审判，亦代表皇帝监督之。刑科较之其他五科，较多有关司法审判之职掌。兹分述如下：
１奉旨审理重大案件《大明会典》定曰：“（锦衣卫），凡奉旨差官出外勘问事情，系会同三法司堂上官者，于指挥内具名上请。会同科道部属官者，于千户内具名上请。”锦衣卫、三法司堂官及司官得奉旨出外勘问审理刑名案件，自不待言。惟刑科虽非三法司，但代表皇帝监督三法司之司法审判，故刑科给事中等官常奉旨出外勘问审理刑名案件。兹举例说明如下：
例一：正统六年（１４４１）八月壬午，陕西署指挥佥事张通、李谅有罪案发，“于是命行在刑科给事中廖庄往复之。庄还言通、谅事多实，所奏镒事皆诬。