从8月下旬至9月2日，艾森豪威尔一再限制巴顿的行动，并且在物资供应上加以严格控制。这种情况直接导致了两人之间的关系有所疏远。但是到了9月4日，他又突然改变了主意，给巴顿开了绿灯，命令他继续向默兹河、法兰克福方向推进。因为艾森豪威尔此时已经清楚地看到：“德军的失败是根本性的，要想彻底摧毁它，最重要的因素是速度。”但不幸的是，艾森豪威尔的反应慢了大半拍，战场形势此时已发生了重大变化，德军充分利用了第3集团军停顿的5天时间，重新部署了防御体系。况且，巴顿眼下进入的是一块不祥之地——位于默兹河以东的洛林地区。
自近代以来，这块土地给法兰西民族留下的是难言的屈辱和噩梦般的记忆。1870年普法战争期间，法军在圣普里瓦特和格拉沃格特等战役中屡战屡败，法军主力部队在梅斯投降，十几万人成为普鲁士军队的俘虏，这成为法兰西历史上最耻辱的一页。在第一次世界大战初期，法军又在此受到德军重创，从而导致全面溃败。这块土地下面埋葬着无数法国将士的尸骨。从地理气候条件来看，这里是摩泽尔河、尼德河和萨尔河的交汇处，水网密布，森林繁茂，地形极为复杂。9～10月份是这里的雨季，降水量极高，届时这一地区将变成泽国，交通中断，商旅不行。历次战争遗留下来的军事要塞和工事，已经变成了德军坚固的防御战线，使这一地区变得更加易守难攻。抢渡江河和发动正面强攻，对于步兵部队来说将会造成巨大伤亡，而复杂的地势又使装甲部队的快速和机动性难以正常发挥。
在巴顿的第3集团军因缺乏燃料停止前进的5天中，德国人在“西墙”一线部署了大量精锐部队，近50万人。希特勒再次启用了战功卓著的老将冯·龙德施泰特，并为他配备了一名年轻精干的参谋长韦斯特法尔。韦斯特法尔在北非作战时是隆美尔的助手，深受隆美尔军事思想的熏陶，他刚柔相济，机智果敢，有相当丰富的战斗经验。德国守军的使命是，充分利用有利地形，阻遏盟军的攻势。很快，德国的战争机器又充满了活力，他们决心利用天时地利，阻挡盟军的前进。
巴顿第3集团军所面对的是德国第1集团军，该部队在二战初期参加过不少大规模战斗，作战经验丰富，以坚韧凶悍著称。9月初的战斗间歇时期，德国第1集团军在美军前沿建立起一条坚固的防线，构筑成强大的防御工事和火力网。由于有一条主干公路经过这里，该集团军的后勤供应也十分方便。这里是整个德军防线中最坚固的地段。
9月4日中午，布莱德雷下达进攻命令。久蛰思动，巴顿兴奋不已，立刻召集军事会议，做进攻的部署：由第12军打先锋，越过帕格尼，占领南锡后，迅速向莱茵河挺进。9月5日，进攻开始。但是巴顿很快就发现，德军进行了有组织的殊死抵抗，第3集团军前进的脚步被严重地阻滞了。
头一天的战斗打得很不顺利。第80师进行了一天一夜的激战，才勉强渡过了摩泽尔河。但在谢讷、马尔巴什和贡德勒维尔等战场，美军的进攻遭到迎头痛击，全线受阻。
第二天的情况更糟糕。第7装甲师派其精锐部队发起渡河战斗，但全部受阻，连已渡过摩泽尔河的第317团第3营也被赶了回来。只有318团成功地突破了马尔巴什防线。
面对这种局面，巴顿只得重新部署了军队，准备下一阶段战斗。他十分气恼，认为这全是布莱德雷的错，由于这位上司优柔寡断，致使第3集团军坐失了良机。
但战局进一步复杂化，德军开始进行反攻了。
1944年9月，巴顿率部下在第3集团军司令部门口恭候盟军最高统帅艾森豪威尔的到来，爱犬威利也参与其中。9月8日是令巴顿沮丧的一天。天刚亮，德军第106装甲旅就在奥梅兹突然发动进攻，他们在90师防区穿插行进，打得美军措手不及，甚至一度攻入师部。直至下午，敌军的攻势才被遏制住。与此同时，另一支德军向第80师发动猛攻，并夺回了马尔巴什。在梅斯、多尔诺等地也有激烈战斗。第11步兵师和7装甲师则一度被牵制在各自的阵地上，只有招架之功。
正当第3集团军与德军进行激烈的拉锯战的时候，布莱德雷采取了一个大胆的军事行动。通过纵观全局，布莱德雷看到，由于第3集团军的猛烈进攻，把大批德军吸引到了这一战区，从而造成了某些地段兵力空虚。于是他当机立断，命令第1集团军立即攻击“西墙”，向德国境内推进。这一举措对整个战局发生了积极的作用，它完全遏制了德军，使其不敢再向前推进，而美军的进攻则取得了明显的进展。
这时，天气突然转冷，阴雨连绵，第3集团军的将士们在雨水和泥泞中奋力向前推进。12日，第7装甲师终于渡过了摩泽尔河，进入阿纳维尔的桥头阵地。第80师在迪厄卢阿强渡成功，其余几支部队也分别在迪厄卢阿等地强渡成功，建立起了稳固的桥头阵地。肃清战区内残敌的工作也在顺利进行之中。就在这时，传来了一个振奋人心的消息，第1集团军已经突破了“西墙”，正在进入德国境内。
在友邻部队辉煌战绩的激励下，巴顿与他的几个主要助手一起部署了下一步行动，决定于9月18日发动一次强大攻势，突破“西墙”，向莱茵河方向挺进。
但天有不测风云。9月18日这一天，德军突然向吕内维尔等地发起猛攻，美军毫无防备，被打得节节败退。在关键时刻，一支坦克机动部队及时赶到，打退了敌人的进攻，才稳住了阵脚。德军的这一举动打乱了巴顿的作战部署，进攻计划不得不改在第二天实施。
9月19日，第3集团军发起强大攻势，尽管受到德军的顽强阻击，但还是取得了稳步的发展。至25日，第20、12、15军各前进了十几千米，占领了南锡等战略要地，在摩泽河上建立了稳固的桥头阵地。
但就在第3集团军又一次要大步前进的时候，最高司令部下了一道新的命令，给他们的战斗热情泼了一大盆冷水。由于战局发展迅速，汽油和其他物资的供应又告急。因此艾森豪威尔决定，只保证重点地段的攻势。这样一来，担任主攻的北路部队得到了物资供应的优先权，而巴顿的第3集团军只能在原地待命。接到这一命令后，巴顿马上意识到他的在近期内攻至莱茵河的计划又要泡汤了。他毫不掩饰自己的怨气，沮丧地对部下说：“我们的供应又被削减了，这肯定是蒙哥马利捣的鬼！”此时，第3集团军的各个部队都在各自的战斗位置上，与德军进行着殊死的搏斗，正在一步一步坚定地向前推进。而巴顿则又要因后勤供应的问题而迫使他们停止战斗，他的懊恼心情是可以想象的，巴顿和他的部队就像被困在笼子中的猛兽一样焦躁不安。
通过长期的共同战斗，尤其是经历了盟军内部的明争暗斗之后，布莱德雷此时已经成了巴顿最坚定的支持者和盟友。他越来越理解巴顿了，他希望能运用手中的权力帮巴顿一把。于是，他玩弄了一下“军事术语”，授权巴顿可以“对战线进行一些小的改动”。巴顿对此心领神会，立即加以大胆发挥，把它解释为，可以“立即进行一些小规模作战，以便获得有利的出发阵地，为未来的进攻做准备”。为了使自己的作战命令与最高司令部的战斗部署相吻合，以比较隐蔽稳妥的方式贯彻自己的作战意图，巴顿在许多场合对艾森豪威尔的命令做了广义的解释，尽可能在守势中采取攻势。9月25日，他给第3集团军下了一道正式命令。该命令要求部队严格执行艾森豪威尔的指示，即“转入防御状态”，但同时指明，导致这种状况的原因是“物资供应问题”。因此他要求部下控制一条出击地带，“以备恢复攻击时可以迅速行动”，同时严守机密，以防止“我军作战态势的改变”被敌人探知。在下这道命令的时候，巴顿心中想的是：“一旦上级命令恢复攻势，我们就可以迅速地向前推进。”
根据巴顿的军事部署，9月底以后，第3集团军战区中大规模的进攻战虽然消失了，但中小型战斗却时有发生，巴顿部队没有停止前进的脚步，他们仍然以英雄的气概和惊人的胆略谱写着光辉的战斗篇章。
9月30日，希耶河以东的第35师遭到敌人一个军的大举进攻，造成了较大伤亡。第12军军长埃迪在举行的军事会议时也遭到突然袭击，险遭不测。情势岌岌可危，第35师准备撤回希耶河西侧。得知这一消息后，巴顿火冒三丈，立刻打电话把埃迪臭骂了一顿，说他是“胆小的老鼠”，并当即宣布命令：“第35师必须与阵地共存亡，不能后退半步！”随后，他火速赶到第6装甲师司令部，亲自组织部队从侧翼对敌反攻。直接干预往往能达到立竿见影的效果，第二天德军就被击退了，第35师不仅保住了阵地，而且还向前推进了约8千米。
在此期间，巴顿还接受了沃克将军的一个大胆建议，向梅斯发动强大攻势。梅斯是德军在该地区的重要军事要塞，防御工事极其坚固。它的外围有层次复杂、极为坚固的堡垒群，要塞内部壕沟纵横，铁丝网密布，到处都是混凝土构筑的火力点和炮位。要塞设有10余个炮兵阵地，地下还有长达数十千米的交通坑道把各个阵地连成一片，形势十分险要。沃克的作战方案是，先从空中对梅斯外围的堡垒群和堡垒的中心阵地进行集中轰炸，最后用步兵和反坦克炮兵发起攻坚战。这确实是一个大胆的计划！巴顿很快就批准了。他认为，此役虽无全胜的把握，但至少应达到两个目的：其一，对梅斯的防御体系进行武装侦察；其二，摧毁敌防御体系的主要设施。战斗于9月27日打响，至10月10日结束，进行得相当激烈，双方都付出了惨重的代价。虽然由于敌人火力过于猛烈和美军投入的兵力有限，最后未能攻克梅斯，但由于美军组织了有效的空地协同作战，巴顿所预期的两个目的都实现了，为以后夺取梅斯城奠定了坚实的基础，也为美军进行攻坚战积累了经验。
随着气候日益转冷，认为战争将在圣诞节前结束的梦想已经破灭了。阴雨绵绵，冷风刺骨，单调乏味的战场生活以及异国怀乡之情严重地困扰着盟军将士们。在许多部队中，士气不振和军心涣散像恶性传染病一样迅速蔓延，军营里弥漫着抱怨和沉闷的气氛，非战斗减员和违纪的现象层出不穷，甚至还出现了士兵因厌战思乡而导致的自残事件。另外，由于严寒而引起的各种疾病（如流感、“战壕足”等）也在军中广泛流行。令许多人不解的是，巴顿的第3集团军却没有出现这种现象，全军上下始终保持着高昂的士气和战斗欲望，减员和违纪事件也十分少见。是什么因素在起作用呢？这与巴顿的为将之道和治军原则有密切的关系。