赫斯死后，他的家人便要求律师让施潘道监狱将赫斯的所有私人物品交出来，然而，施潘道监狱和赫斯待过的小别墅早已被夷为平地，赫斯所有的私人物品也跟着消失得无影无踪。据当时掌权的部门解释说，他们是为了防止纳粹势力余孽借机兴风作浪才把它们拆除的，赫斯的家人可以带走赫斯的尸体。在对赫斯进行公开验尸时，英国法医詹姆士·卡梅隆证实了赫斯用电缆上吊自杀的说法。
但是赫斯的家人却不能接受这个现实。在赫斯儿子的强烈要求下，赫斯的尸体被运到了慕尼黑。由慕尼黑法医学院在1987年8月21日对赫斯进行了第二次验尸。专家发现：死者脖子上有绳索多次缠绕过的迹象，勒痕呈平行状，没有任何自杀痕迹，实属谋杀。
于是有人怀疑谋杀赫斯的是否就是苏联人。因为多年来，国际社会一直呼吁四国政府以人道主义精神将赫斯释放，但都遭到了苏联的反对。在1987年苏联新领导人戈尔巴乔夫上台之后，莫斯科放出消息称他们可能会将赫斯释放。接着在1987年4月，德国的各大报纸纷纷报道称，戈尔巴乔夫已经正式承认，赫斯即将迎来自由的人生。
由于赫斯是纳粹的创始人，在德国右翼分子当中的影响力非比寻常。其特殊身份使得他在死亡之谜的调查上存在很多顾忌。在当时的官方记录中也存在着不少的疑问：即使赫斯真的万念俱灰，也根本不可能将自己吊死。因为当时的他已患有软骨病，是一个手无缚鸡之力的人，甚至连扣衣扣和系鞋带都要别人帮忙。所以，这样的人怎么可能拉断一根粗长的电缆，再把它套到自己的脖子上呢？
那么赫斯究竟是死于自杀还是他杀呢？恐怕这还需要进一步的调查研究。
海德里希失踪之谜
多年以来，海德里希的下落被全世界的历史学家公认为第二次世界大战最神秘的谜团之一，因为他死不见尸，活不见人。
纳粹分子海德里希被称为杀人魔王，他是第一次世界大战中最著名的德国战斗机飞行员之一。战争结束后，他成了慕尼黑的一名警察。到了20世纪20年代末，海德里希成了慕尼黑警察局一名反共秘密干将。他写的反共秘密报告引起了纳粹冲锋队头目和盖世太保首领希姆莱的注意，于是他在30年代短短几年时间连升好几级，直至成为盖世太保秘密行动一把手，还一跃成为纳粹德国最有实权的人物之一。权力使海德里希终于有机会大开杀戒：他是1942年1月20日制定屠杀欧洲犹太人的“最后解决方案”的15名纳粹高级官员之一，这一政策使600万的犹太人于1942年至1945年间在集中营里被残杀。战争临结束前，他亲自下令处决所有布切法斯特集中营里的关押人员。海德里希是名副其实的纳粹大屠杀元凶。
多年以来，海德里希的下落被全世界的历史学家公认为第二次世界大战最神秘的谜团之一，因为他死不见尸，活不见人。长久以来，有关海德里希最终下落的说法主要有4种。
第一种说法多是德国一些历史学家提出的。他们认为海德里希离开希特勒的“鹰巢”地堡后登上了一辆装甲车，准备溜之大吉，但没想到在去柏林的途中与盟军坦克部队相撞，结果死于炮火之中。1963年，甚至有人宣称发现了海德里希的坟墓，里面还有海德里希的尸骨。然而，当科学家们对从坟墓里取出的头盖骨进行科学检验后发现，这个头盖骨的主人比海德里希死时要年轻15～30岁，显然这种说法没有有效的证据。
第二种说法盛行于民间，认为海德里希乔装改扮溜到了中东的埃及，或者到南美继续干他的纳粹秘密勾当，从此过上隐姓埋名的生活。此后，先后有人声称在前东德、瑞士、阿根廷、巴西、巴拉王、大马士革、新汉普郡，甚至华盛顿看到过他。
第三种说法是，海德里希其实早在希特勒自杀前两天就杀死了自己的妻子和3个孩子，然后自杀身亡。
而第四种说法认为海德里希离开柏林总理府地堡后落入了苏联红军的手里，他用情报换得一条生路，苏联情报部门给他一个新的生活，从此在苏联国内过上平静的生活。甚至有关于海德里希落入美国人手中，并成为冷战工具的传说。这使得国际犹太组织强烈要求美国政府和国会立即对这一事件进行彻底的调查。
专门负责在世界范围内追捕纳粹战犯的美国官方机构则表示，有证据证明美国人拘禁了海德里希的说法确实“非同小可”。实际上早在1996年该机构就已经开始着手对海德里希的下落进行调查，并且要求美国中情局、司法部和当时的国防部长科恩按《信息自由法案》提供海德里希的有关档案，然而，各方对“西蒙·文森塞尔中心”的要求置之不理，直到两年后，该中心被告知，出于保护国家安全的考虑，绝大部分关于海德里希的档案仍属保密，所以不能交给中心。
那么究竟这个杀人魔王的下落之谜何时能破解，看来还需要一些时间。
山本五十六丧命之谜
山本五十六是日本海军大将，他素有战争赌徒的称号。青年时期，他参加过1905年的日俄战争，后来曾出使美国、英国、法国和比利时，任过日本驻美国大使馆武官。第二次世界大战时，由海军省次官转任日本海军联合舰队司令官，发动了闻名于世的太平洋战争，亲自指挥偷袭美国珍珠港海军基地，策划中途岛的作战方案。山本五十六是太平洋战争中日军的直接指挥者，是当时仅次于天皇裕仁和东条英机首相的第三巨头人物，是日军中被认为最有魄力、最有胆识、最精明能干的指挥官。山本五十六建立了现代化的日本海军，奠定了海军航空兵的基础，并使这一兵种成为主要的打击力量。第二次世界大战日本最优秀的零式战斗机就是在山本五十六的协助下诞生的。山本五十六精心策划了偷袭珍珠港的行动，使美国太平洋舰队的战舰几乎全军覆没，因此，美国人一直把山本五十六看做是太平洋上一个最难对付的敌手。但是这个强大的敌人却在1943年4月18日坠机身亡了。这究竟是怎么回事呢？
很多研究者根据当年的记载认为，是美国人暗杀了山本五十六。据记载，为了使这项暗杀任务顺利实施，美军进行了周密的空战部署。美军决定在山本五十六座机降落前10分钟于机场北面56千米处的上空对山本五十六的座机进行截击，并准备挑选18架P-38闪电式战斗机，分两个机群从所罗门群岛的瓜岛起飞前往截击。经分析判断后认为，若山本五十六完全按时到达的话，将在9时45分与山本座机相遇，具体由米歇尔中校率12架P-38闪电飞机负责掩护，在高空诱开并纠缠住山本五十六的护航机。米菲尔少校带6架P-38闪电式飞机组成阻击机队，从低空出其不意地对山本五十六的座机进行空袭。总之，要不惜一切代价暗杀山本五十六，击毁山本五十六的座机。哈尔西少将最后强调，无论付出多大代价，多大牺牲，也必须暗杀山本五十六这个敌人。
对于负责执行这项坚决使命的美军来说，这是一项最严厉的命令，即使到时候与敌机冲撞，同归于尽也绝不能放跑血债累累的山本五十六。
山本五十六的座机于东京时间4月18日早晨6时整，准备离开腊色尔岛，同机的有他的秘书、舰队军医长和航空参谋长，宇垣参谋长坐另一架三菱制造1式轰炸机，机内还有6位参谋人员。18日早晨7时，美国仙人掌航空部队第339队的18架P-38闪电式战斗机做好了随时出击的准备。
4月19日下午18时，日本大本营发布通报，日本联合舰队司令官海军大将山本五十六于本月18日在前线全盘指导作战中遇敌。座机遭伏击而壮烈殉职，现另派海军大将古贺峰一接任遗缺，指挥联合舰队继续作战。
可以说，当时美国政府暗杀山本五十六是太平洋战争中最富戏剧性的事件。山本五十六被暗杀，对日本朝野如晴天霹雳，对东京大本营来说，是战争爆发以来一次沉重的打击，被日本大本营称为“甲级事件”，美国人终于为珍珠港事件的死难者报了一箭之仇。但是也有专家认为，山本的真正死因不是如此，他们认为，1943年4月18日，美军根据破译的日军密电，成功地击落日本联合舰队总司令山本五十六的座机，这个法西斯恶魔当场毙命。然而，山本五十六之所以难逃此劫，和日军飞行员在此前空中作战中谎报战功有关，致使受到天皇赞扬的山本五十六利令智昏，最终走向死亡之路。
那么山本五十六真正的死因究竟是什么呢？至今还很难说清。