大清初期，海曲县有一个叫“双槐堂”的药铺，掌柜名叫林栋梁，有着一手妙手回春的手艺，林栋梁有了一个独子，名叫林简青，从小就跟着父亲行医，十几岁时，林栋梁就给了他一些银两，叫他周游天下，遍访天下名医，和他们切磋技艺。
林简青二十岁时，回到了家乡，却见家中药铺大门上贴着封条，他不知出了什么事情，就急急回了家，母亲一看见他，那眼泪就刷的流了下来。
原来，林栋梁药铺中的大多数药材都是从附近山上采得，但是也有一部分是自己家种的，他家祖传下来一块地，土质肥沃，林栋梁就在上面种上大麦、丹参之类的药材，每一年都能获得大丰收。
这一天，村中地主刘财来到了林家，林栋梁忙让座看茶，两个人寒暄几句，刘财就说出了前来的目的，原来刘财的父亲前几天病故，他听风水先生说林栋梁家的那块地是一块风水宝地，刘财就想买下来，林栋梁婉言谢绝了。
这天，林栋梁正在药铺里教活计碾药，忽然一个中年汉子跌跌撞撞的跑进来，说，自己的娘子正在家里生产，但是因为胎位不正，难产生不出来，求林栋梁开一付汤药，林栋梁就亲自给那个汉子开了一剂中药，那个人匆匆而去。
第二天，药铺刚一开张，就有一队衙役冲了进来，直接给林栋梁戴上了枷锁，然后说：“王家村王三告你用毒药毒死了他的妻儿，县太爷让我们带你过堂。”
到了县衙，林栋梁就看见昨天那个汉子正跪在里边，一见他来，那个汉子开口大骂：“庸医，你还我妻儿的性命来。”
从县官口中，林栋梁才明白了事情原委，原来昨晚那个王三拿到自己的药，剪了给妻子服下后，谁知他妻子服下之后不但没有顺利的产下孩子，还浑身痉挛，不一会就散手归西了。
王三接着就报了官，县官带着仵作前来检验之后，确定那妇人是服毒而亡，王三就把林栋梁给告了。
因为林栋梁不承认自己用错了药，县官就开始用刑，年迈的林栋梁受刑不住，只得承认了是自己下毒害死了那母女两，并在认罪状上签了字画了押。县官就将林栋梁关进大牢，等待秋后问斩，同时封了“双槐堂”药铺。
林简青正听着母亲讲述，忽然外边敲门，开门一看，却是刘财，他一进门看见了林简青，就打着哈哈说：“这不是林家大公子回来了吗，有失远迎呀。”林简青没有理会他。
刘财接着说：“现在你家的药铺都被封了，种那些药材也没有了用处，不如就把那块地转给我，我给你一个好价钱。”林简青这才明白这一切都是这个家伙在捣鬼，一气之下，抄起一只扫帚就把刘财给打走了。
几天过去了，林简青却想不出任何主意救父亲，不由得愁上心来。
这天，伙计林二去城里办事，又从城里带回了一个好消息：当今皇上身染沉疴，宫中御医束手无策，正到处贴告示在民间寻求名医前去救命呢。
原来，在从前，只要是皇上身边发生的大事，如皇上添了皇子，皇上大婚，皇上驾崩……一直有个规矩，那就是会大赦天下，眼下这皇上无药可救了，一旦驾崩，那么自然地林栋梁就也会被放出来了，这岂不是一个天大的好消息。
林简青就将这个“好消息”告诉了狱中的父亲，父亲一听，说：“当今皇上是个明君，他登基之后，百姓得以安居乐业，这样的国君我们应该祝愿他长命百岁，怎么能咒他快死呢？你赶紧进京，去救皇上一命。”林简青说：“可是那样一来，爹爹你的命就保不住了。”林栋梁说：“你是个聪明人，国事家事，你应该分得清楚孰重孰轻，还要我说吗？”
林简青就卖掉乐一部分家产，买了一匹良马，开始快马加鞭的向京城进发。
经过一番长途跋涉，林简青终于到了京城，直接就揭了贴在京城上的皇榜，守城士兵一见，就将林简青送到了皇宫里边。
此时的皇上已经奄奄一息了，林简青试过了他的脉搏，然后拿出了一包中空银针，找准了几个穴位就给皇上插上了，只见一股股的浊气就从那些空中缓缓排出，过了好一会，皇上睁开了双眼。
林简青亲自去御医处抓了一些药材，又亲自剪了，给皇上喂下去，这样照顾了半个月，皇上的身体就没有什么大碍了。
病愈后的皇上对林简青感恩戴德，问他有什么要求，是想做官还是想要银子，林简青摇了摇头，接着扑通一声给皇上跪下了，说：“皇上执意要封赏草民，那就请您放我尽快回乡，否则我就看不到我爹最后一面了。”皇上忙问起是怎么回事，林简青就流着眼泪说了一遍。
皇上听罢又喜又怒，喜的是自己的子民还有觉悟如此之高的，为了救治自己，不惜舍弃自己的性命，怒的是，那个县官竟敢为了蝇头小利，草芥人命，当即，他命令吏部尚书前往海曲县，调查此事原委。
吏部尚书经过一番调查，弄清楚了事情的原委，那个县官被撤职查办，王三被判秋后处斩，刘财被判下了大狱，家产被抄，林栋梁则被被无罪释放了。
皇上想留林简青做贴身御医，林简青却说：“草民留在皇上身边，只能给皇上一个人服务，而草民的志向却是为普天下的老百姓治病。所以还请皇上收回成命。”皇上不禁赞叹道：“林爱卿医术高超，医德高尚，扁鹊、华佗之流尚不能比，堪称‘天下第一名医’了。”