咸丰十年（公元1860年）九月，清朝与英法联军的和议达成，皇上命令遣返撤回残余军队，僧格林沁驰赴行营所在，尚未实行，赶上京畿南部土匪正在蜂起，山东地区抢军猖撅一时，便又恢复僧格林沁郡王的爵位，命令他偕同瑞麟前去进剿。部队到达河间，捻军大多自行解散。皇上下诏催促他赶赴济宁、兖州督师。十一月，僧格林沁到达济宁，捻军已经逃窜到别处而返回其巢穴。
僧格林沁上疏陈奏军事，大致上说：“捻军首领张洛行、龚瞎子、孙葵心等等，各自聚集许多匪党。此外的其他大小头目，人数也不少。每年几次出动劫掠粮食，动辄前往没有官兵的地方。等到官兵进剿，则匪徒已经饱掠而归。他们每到一个地方便抢掠资财粮食，把村舍烧成一片焦土，杀害老弱之人，裹胁少壮之人。百姓不跟从叛逆，也无家可归。因此捻军出动一次，就会增加许多人数。这便是捻军众多的根源。捻军巢穴四周一二百里外，村庄被焚烧得荡然无存，井也被填塞。这样官兵裹粮带水，怎么能够跟捻军持久呢？一旦官兵撤退，捻军便跟踪追击，官兵因此往往失利。这便是各路官兵仅仅能够防堵抵御，却不能进攻的原因。每次捻军出动，骑兵、步兵数十万人，队伍排列达百余里。官兵、捻军众寡悬殊，任凭其肆意猖獗，却无可奈何。过去太平军、捻军各树旗帜，近年来却彼此互相沟通，联为一气。官兵位于北面，太平军位于南面，而捻军居其中，充当太平军的屏障。如果大量调集兵力，分头进剿，捻军一受惩创，太平军则蠢蠢而动，不是竭力进行帮助，就是另外谋图向北进犯，以求分散我军势力。这便是剿灭捻军不容易的原因。我原本带领骑兵和步兵六千人，后来又陆续调来陕甘、山东的绿营兵以及青州八旗兵，共计一万二千余人。我准备等部队到齐后，会合傅振邦、德楞额二支军队，寻找时机直捣捻军老剿。”奏疏呈送上去后，皇上下诏说：“捻军正在谋图向北进犯，应当坐镇山东，以杜绝其窥伺，不要轻举妄动而贻误全局。”不久，捻匪由徐州向北窜逃，僧格林沁在恒野羊山加以迎击，亲日率领西凌阿、国瑞在东面阻挡，让瑞麟及副都统格绷额在西面阻挡，杀死敌军很多，而格绷额在战斗中被打死。瑞麟受伤退兵，上书弹劾罢免其职，荐举西凌阿、国瑞帮着办理军务。又弹劾团练大臣杜蘅不能抵御敌军，供应军需时骚扰百姓，罢免其职务，使团练归巡抚督办。邹县教匪宋绍明纠合数千人杀害官员，他便命令国瑞、西凌阿进剿而使其解散。