同日申时，发出致中共中央军委并刘伯承、陈毅、邓小平、华东局、许世友、谭震林、华北局电，报告睢杞战役战果和当面敌情，已歼敌第七十五师等部约12个团4万余人，判断“敌有东西齐进夹击我之企图”。“我们原拟全歼黄百韬兵团，估计要齐（8）日晨始能解决战斗。歼灭该敌，均具有信心，惟势将被迫与援敌作战，对我不利。故决定放弃歼黄计划，本晚就现态势抢运伤员（伤亡近万，因无担架，堆集一线仍多）与战利品，虞（7日）晚向北转移，争取调整组织与弹药补充待机。”
同日24时，指挥华野各部撤出战斗。睢杞战役胜利结束，歼灭国民党军五万余人。
7月7日未时，中共中央军委致粟裕电，指出：国民党军张轸兵团受我军威胁，第二十八师及第三师一个旅被迫南援，第十八军三个旅停止于周口地区。
你们南面是安全的。只要你们能够对付东西援敌，在原地再顿几天是可能的。粟裕、陈士榘、唐亮、张震于同日酉时复电，报告援敌动态和我军决策：白崇禧以豫东作战关系整个中原之安危，令胡琏兵团兼程北上，令张轸兵团按原计划继续北上，昨天中午第十八军先头部队已到淮阳西南的李集。同时，刘汝明兵团与邱清泉兵团亦有东西夹击我军企图。“根据上述情况，加以我们部队作战近月，已很疲劳，且组织尚未整理。为应付可能的敌人乘我疲劳后之进攻，故决放弃对二十五师（要齐日午才能解决战斗）等部之作战，即现北撤民权、考城、菏（泽）、曹（县）、（定）陶地区，争取休整”。7月8日午时，中共中央军委复电指示：“在来电所述各种情况下，你们的撤退是正确的”。“望你们于十天内完成再战准备（整理组织，补充弹药，恢复疲劳），以利再战”。
7月8日11时，发出进入鲁西南地区休整的部署命令。率领华野指挥机关和部队向鲁西南开进，于7月11日到达山东单县。为摆脱邱清泉兵团尾击，决定留第十一纵队在单县附近，华野指挥机关率第四、第六纵队进至定陶周围，第一、第三纵队越陇海路南下，第十纵队进入豫皖苏地区，成互为犄角之势，保证部队休整。
同日刘伯承、陈毅、邓小平报中共中央军委电：华野既已收兵，白崇禧令第十八军回周口，我拟移平汉路休整。
同日申时，中共中央军委致刘伯承、陈毅、邓小平并告粟裕电，指出：
“白崇禧七日四时令胡琏按原计划北上，张轸在击破我军后亦兼程北上，此情你们谅已获悉”。“如果胡、张继续北进企图集全力先击破我粟部，则你们应率全军北进援助粟部；如果胡、张停止北进则你们亦可停止北进，惟正式休整计划须待蒋介石全般部署明了后方能决定”。“总以使粟部取得喘息时间，立于主动地位为原则，此种时间大概要十五天”。
7月9日酉时，与陈士榘、唐亮、张震联名发出致中共中央军委并报中原局、华东局、华北局电，报告一个月来战况、北撤经过和部署，建议增建辎重担架部队。“睢杞战役我本可全歼区（寿年）兵团，因二十五师迫近，为乘其立足未稳，故放弃对七十二师之攻击，改而歼黄（百韬）兵团。因部队疲乏，三面援敌迫近，我无新生力量增加，故仅歼黄兵团三个团部，撤出战斗，以期稍事整补再战”。在北撤过程中，本已从容离开战地，但因担架队少且缺乏战斗经验，部队被迫掩护作战，还要自己抬运伤员，致损失伤员数百名。“鉴于此次教训，辎重担架部队甚为必要”。
7月10日与陈士榘、唐亮、张震联名发出致中共中央军委电，报告：渡江先遣纵队孙仲德、马长炎部一个连已渡过长江。
7月11日中共中央为豫东战役的胜利发出贺电：“庆祝你们继开封胜利之后，在豫东歼灭蒋敌区寿年兵团、黄百韬兵团等部五万余人的伟大胜利”。“这一辉煌胜利，正给蒋介石‘肃清中原’的呓语以迎头痛击；同时，也正使我军更有利地进入了中国人民解放战争的第三年度”。包括开封、睢杞战役在内的豫东战役，共歼灭国民党军1个兵团部、2个整编师、4个正规旅、2个保安旅，共9万余人。
7月12日与陈士榘、唐亮、张震联名发出致华东局、中共中央军委电，提出援助许（世友）谭（震林）兵团攻兖、济的部署。
同日黄昏，许世友、谭震林兵团发起兖州战役，于7月13日攻克兖州，全歼守敌第十二军，并于7月16日迫使济宁、汶上守敌逃走，济南援敌北返，乘势歼其后尾部队第八十四师一部，共歼敌63万余人。7月18日，兖州战役胜利结束，使国民党军驻守的济南陷于孤立。
同日华东野战军政治部致中共中央军委、总政治部、中原局、华东局电，报告6月初至7月半华东野战军部队情况。
7月13日中共中央致中原局并告粟裕、陈士榘、唐亮电，改变原来要粟裕兵团在中原地区作战4个月至8个月的决定，指示：“粟兵团应在现地区作战至明年春季或夏季，歼灭五军、十八军等部，开辟南进道路，然后南进（不歼灭五军、十八军不走）。”
同日与唐亮、钟期光一起到成武县阎楼，参加渡江先遣纵队南征誓师大会，就先遣纵队的工作方针、任务、步骤以及干部调整、统一领导思想等问题作指示。
7月14日中共中央军委发出解放战争第三年的军事计划，提出歼灭国民党正规军123个旅（师）左右，把革命战争继续扩大和深入到国民党统治区。指示各解放区战场发起秋季攻势。
同日中共中央军委致刘伯承、陈毅、邓小平并告粟裕、陈士榘、张震、许世友、谭震林、华东局电：“拟令许、谭攻济南，如能在八、九两月攻克济南，则许谭全军（七纵、九纵、十三纵、渤纵、鲁纵）可于十月间南下配合粟（裕）陈（士榘）、韦（国清）吉（洛）打几个大仗，争取于冬春夺取徐州”。
同日寅时，中共中央军委致粟裕、陈士榘、唐亮、张震并告许世友、谭震林、中原局、华东局电，指出：“估计敌人似将利用你们疲劳，集中力量向你们压迫，使你们不能安心休整。似须以有效行动分散敌人，你们则乘敌分散之际，歼灭几部敌人，方能实行大休整（许谭、韦吉亦然）。此种分散敌人的行动，似以许谭攻击济南为最有效”。又指出：“目前许谭不宜和你们集中行动，若许谭加入鲁西南，将迫使邱（清泉）、黄（百韬）集中，不易求得歼击机会”。
7月15日发出致中共中央军委电，报告敌军动态和华野部署：邱清泉兵团由定陶向北进犯，黄百韬兵团进至成武及其以南地区，第四十七军在菏泽临濮集地区破坏黄河渡口阻止我军物资北运。决定于7月16日晚率华野指挥机关和第四、第八两纵队越陇海路南下，进入豫皖苏永城以北的陈集地区。
7月16日子时，中共中央军委致许世友、谭震林并告粟裕、陈士榘、唐亮、张震电，指示：“你们歼灭八十四师后除以一部兵力歼灭济宁、汶上之敌，并负责扼守运河要点阻止可能之敌东渡以外，主力应不惜疲劳抢占济南飞机场，并迅速完成攻击济南之准备，以期提早夺取济南。”
同日子时，中共中央军委致粟裕、陈士榘、唐亮、张震并告许世友、谭震林电，指出：“如果济南敌人不强而我军又能于短期（例如十天左右）完成攻城准备，则有迅速夺取济南之可能”。“我攻济南时，判断邱（清泉）兵团可能取道郓（城）巨（野）东进北援，而黄（百韬）兵团则将设法返回徐州”。为此提出阻击邱、黄两兵团北援济南、东援徐州的方案。
同日午时，中共中央军委致许世友、谭震林并粟裕、陈士榘、张震告华东局、中原局电：“攻克兖州又歼八十四师甚好甚慰。望鼓励士气，于尽可能短促时间完成对济南之包围（首先夺取飞机场），并乘胜夺取济南。如有可能，你们应争取于十天内外夺取济南。”
同日午时，中共中央军委电示华野苏北兵团：“目前二十天至一个月内，应不惜疲劳与减员再打几个小的及中等的仗，在可能条件下争取攻占睢宁、灵璧及该区某些据点，控制徐蚌以东、陇海以南广大地区于我手中，配合粟军威胁徐州，援助许谭夺取济南，不要马上进行休整”。
同日午时，与陈士榘、张震联名复中共中央军委并报华东局、中原局、许世友、谭震林电：“军委寒寅（14日寅时）令许谭兵团即进攻济南两电均悉。如果该部署主要是为了分散敌人，以帮助我们赢得时间休整，则我们意见不必如此。因此间各纵除四、八两纵外，疲劳已大体恢复，仅弹药尚未得到补充，正争取分别补充中，半月至二十天内大致可完成。即或黄（百韬）邱（清泉）兵团仍全力转向我们，我们亦可采分散或犄角形势，以争取休整”。“以许谭本身和今后作战需要，目前亦以留兖济休整为宜”。“目前如即以许谭一部抢占济南机场，则恐部队本身困难，难以连续作战，且势必迫敌北援，如是兖济仍有被敌占去可能。以许谭现有主力攻济南与打援，势难得手。如以许谭专任攻济南，兵力虽可，但时间需长，敌仍可能来援。如邱（清泉）刘（汝明）两兵团北援，则许谭专任打援，亦感兵力不够。因此，建议许谭与我们争取休整时间一月，而后协力攻打济南，并同时打援，于打援中选择有利阵地，求歼邱兵团之大部或全部，均属可能。为求迅速攻占济南，必要时，此间可抽出几个长于攻坚速决的部队参战（估计有半月时间即可）。只要济南解决，打援方面又取得胜利，则战局可能迅速向南转移，今冬攻占徐州之计划，似属极大可能”。
同日未时，中共中央军委电示：“许谭在现地休息一、二天，应不惜疲劳减员迅即北上包围济南，并争取于十天内外攻克之。粟陈张率四、八纵（17日）晚攻占砀山、黄口线并准备歼灭黄兵团，计划甚好”。
7月17日许世友、谭震林于午时、酉时连发两电致中共中央军委、华东局、粟裕、陈士榘，决定于7月22日攻击济南，请求粟陈兵团全力支持攻济，拖住邱清泉、黄百韬两兵团。中共中央军委于7月17日酉时复电指示：“许谭所部暂在现地休息待命，看粟陈唐占领砀徐段及他部击破徐蚌段后，邱兵团动作如何，再定是否提早攻击济南。”23日，中共中央军委又电示许世友、谭震林并粟裕、陈士榘、唐亮、张震：“按照粟部情况目前难于进行作战，雨季又到，你们各纵应即进入休整”，“粟、陈、唐、张所部亦照此休整，韦吉所部何时开始休整由粟、陈、唐、张规定令行”。“休整完毕，或配合粟、陈、唐、张各纵在陇海南北打几仗然后攻济南，或先攻济南并打援，由粟、陈、唐、张依情况提出计划并统一指挥”。7月26日又电示：“雨季已到，你们决心进入休整是正确的”。
“下一步作战任务，预定粟陈唐并统一指挥许谭歼灭第五军”。
7月19日刘伯承、陈毅、邓小平致中共中央军委并粟裕、陈士榘、唐亮、张震电：“照我军现在态势，以集中全力加上华野一、三纵队，先歼胡琏一两师为有利”，“请粟陈张令睢杞地区之一、三两纵第一步移通许地区休整，并准备适时西进，参加这次战役”。中共中央军委于7月20日复电指出：“你们争取歼击胡琏一部是好的。惟粟陈唐张所部甚为疲劳，又未补充弹药，未知能否调一、三两纵向西参战。如有困难，则你们须准备独力作战。”同日又电粟裕、陈士榘、唐亮、张震并刘伯承、陈毅、邓小平，指出：“一三两纵向西参加作战甚有必要”，询问：“该两纵能否西移？”7月21日，粟裕、陈士榘、唐亮、张震复电：
一、三纵可负担部分突击任务，惟连队干部伤亡太大，弹药未得到补充。
7月23日中共中央军委致粟裕、陈士榘、唐亮、张震电，询问：所购柴油引擎南渡时是否适用？粟裕于7月26日复电说明，柴油引擎可改装木船为机帆船，供渡江作战使用。柴油需购买，汽油可从敌方缴获，以购买汽油引擎为好。如买不到汽油引擎，亦可买一部分柴油引擎。
7月24日陈毅致粟裕、陈士榘并报中共中央电，对华野负责人以“军事观察家”名义就豫东战役发表的评论（指新华社1948年7月17日播发的《华东军事家评开封及豫东大捷》）提出批评，指出这个评论没有具体提到中野部队在南线钳制胡琏、吴绍周两兵团在西线钳制郑州敌人的作用，陈士榘总结洛阳战役经验时过分夸大炮火作用，第三纵队与友邻部队接触中表现骄傲，希望他们在雨季整训中注意检讨。粟裕、陈士榘、唐亮于7月28日辰时复陈毅并报中共中央军委，表示所指各点完全接受，拟在雨季整训中进行检讨、教育。
同日酉时，与陈士榘、唐亮电示苏北兵团：“你们必须遵照军委以五个旅集结作战之指示”，以战备姿态进行休整，“在思想上与组织上均须有进入淮北地区作战，配合西兵团于陇海南北歼敌之准备”。
7月26日签发华野部队休整计划。7月27日，率领华野指挥机关和第四、第八两纵队进入安徽涡阳、亳县地区休整，第一、第三两纵队进至河南太康、杞县地区休整，第六、第十两纵队进至山东汶上、济宁地区休整，许世友、谭震林兵团集结于泰安、兖州地区休整。
8月3日晨，发出致许世友、谭震林并报中共中央军委、华东局、中原局电，提出歼灭国民党军第五军的作战部署。
同日国民党政府国防部在南京召开军事检讨会议，为挽救“战局危机”作出新的战略部署：“于东北在求稳定，在华北力求巩固，在西北阻匪扩张，在华东华中则加强进剿，一面阻匪南进，一面攻打匪的主力”。将战略重心置于黄河、长江之间，决定将中原战场的机动兵力组建为4个兵团，加上原有3个兵团，共7个兵团，即邱清泉的第二兵团、张淦的第三兵团、黄百韬的第七兵团、黄维的第十二兵团、李弥的第十三兵团、宋希濂的第十四兵团和孙元良的第十六兵团。
8月5日在渡江先遣纵队连以上干部大会上作报告，要求先遣纵队开始独立地执行南进任务，提出在长江沿岸开展游击战争的四项原则：造成部队的热情；造成群众的热情；造成敌军内部恐慌；造成敌人统治机构内部恐慌。
8月6日率华野指挥机关自安徽涡阳出发去河南太康第一、第三纵队，然后率第三纵队去鲁西南定陶地区。
8月10日4时，与陈士榘、唐亮、张震、钟期光联名发出致中共中央军委、华东局、中原局、许世友、谭震林、韦国清、吉洛电，提出雨季休整后的作战方案：“集中华野全部（包括许谭、韦吉共约三十万人），或先攻济南，或先转到外线进行大规模歼灭战的方针”，并提出三个可供选择的方案，“认为以执行第三案为最好”。这个第三方案是：“攻占济南与打援同时进行，但应有重点配备与使用兵力”，“使攻坚与打援有重点地进行，以达一箭双雕之目的”。“此役如能取得决定性胜利，则对下一步全军转到陇海以南亦较有利”，“对下一步孤立徐州作战的目的实行的可能性亦较大”。我们拟于15日赶往兖州，与许世友、谭震林商定下一步作战问题。
8月11日谭震林致粟裕、陈士榘、张震并报中共中央军委、华东局电，建议下一步作战佯攻济南，吸引邱清泉兵团到兖州一线歼灭。