黄帝安排了数名黑衣使者以神“羲和娲”的名义去世界各地传达女娲娘娘的旨意，提醒人族子民躲避大洪水。使者们陆续对世界各地的人族发出了大洪水预警，而断了一根天柱的月球飞碟则以每天下降若干公里的速度准备降落在太平洋上，约一个月后，巨大的月球飞碟降落在太平洋上，月球飞碟的下部分淹没在太平洋深海之中，冲撞挤压地球海面，排挤出的巨量海水引发海啸，汹涌地奔上世界各处大陆，淹没了大多数海拔在约1000米以下的陆地、山林。很多的植物、动物，包括大量恐龙，都被滔滔洪水淹死。世界各地有一部分的人类得以存活，他们是遵照了神的警示而逃过大难，例如：
“羲和娲”到了中东地区，看到诺亚是一位善良的人，于是“羲和娲”对诺亚说：“人类的可憎我再清楚不过了，他们使这世界充满了仇杀，甚至造神的反。我有意要毁灭他们，也毁灭掉同他们一起的这个世界。你要为自己造一艘方舟，用丝柏木做船架，覆盖上芦苇，再在里外两面涂上树脂。我要使洪水泛滥全世界，消灭天下所有活着的人，地上万物也要消灭光。但我要与你立约。你到时就带着你的妻子、儿子、儿媳们一起进入方舟。你还要把各种飞禽、走兽、爬虫，每样两只，雌雄各一带上，和你一道登舟，在船上喂养好。此外还要带上各种吃的东西，储存在船上，作为你们和动物的食粮。”诺亚遵照“羲和娲”的话，一一办到了。
这样，为了躲避洪水，诺亚和他的妻、子及儿媳们都上了方舟。和他一起上船的还有那些动物：洁净的和不洁净的牲畜，每种都是雌雄一对；所有的鸟类和地上的爬虫，也是一对一对的，按“羲和娲”的吩咐那样都上了船。当洪水降临到大地，大深渊的所有泉源一齐喷发起来，天穹洞开，大雨倾盆，不停地下了四十个昼夜。……洪水泛滥了四十天，大水涨起来把方舟托起，高高地升离地面之上。落在地面的水越来越多，淹没了天下所有的高山。水一直涨到浸没高山十五腕尺之深。一切有气息的生物，所有生活在陆地上的东西，全都没有了。“羲和娲”清除了世上的生物，人也好，兽也好，爬虫也好，飞鸟也好，全部从地面上消灭干净，惟独诺亚和在方舟上的他一起的妻子儿媳、鸟兽爬虫活了下来。
另一位黑衣使者“羲和娲”向另一处地处中东的国王发出有关洪水将要到来的警告，他说：“你们快拆了自己的房子造船吧！不要考虑自己的财产，如果生命得救，请为这件事高兴吧，别忘了在船上装上各种动物。”
前往美洲警告人族的使者则向名叫那塔的人发出了关于势必降临的大灾变的警告：“停止用龙舌兰造酒吧！再挖空大杉树的树干造一个独木舟，到特索斯顿特里这月，洪水滔天时，请进到这个独木舟中！”大洪水果然来临了，地上的人都死光了，而那塔和他的妻子却逃脱了灭绝。当洪水退去后，那塔和他妻子开始点火烧鱼。烧鱼的香气四处扩散，阵阵飘到天上。
在收到大洪水预警的人类中，有的先哲为了避免知识遗失，为了给后人留下宝贵的知识，把自己所知道的重要知识保留下来，他们说服祭司、帝王将相们把各种得到的知识、艺术以及科学成果藏在或者刻印在石柱、高山洞穴、金字塔等不易被破坏的地方，为人类留下了珍贵的知识种子。