应龙师在得到黄帝的授权后，在南极基地遥控指挥军事卫星瞄准亚特兰蒂斯，准备打击蚩尤国。后羿使用“女娲”号运载火箭运送到太空站上的十颗卫星，就是军事卫星，是十个反物质武器，是女娲娘娘与黄帝全力打造的终极大杀器，不到万不得已不会使用。形势越来越危急，月球飞碟受损面扩大，应龙师果断按下反物质武器发射按钮，同时启动十颗军事卫星反物质太空武器，轰击亚特兰蒂斯重要据点。应龙师与夸父同时率领空军前往蚩尤国准备进行进一步的轰炸。
蚩尤国的能源中心被摧毁，整座城市失去能源供给。在如此巨大能量的轰击下，亚特兰蒂斯的火山也开始冒烟，有随时喷发的迹象，蚩尤国好像是处于地震之中。蚩尤已经意识到黄帝是动了杀机，要把亚特兰蒂斯从地球上抹去。自古胜者为王，败者为寇，也没有什么怨言可讲的。
亚特兰蒂斯处于地动山摇之中，由于能源被截断、毁坏，针对月球飞碟的远程攻击无法再继续进行，在反物质武器的攻击下，亚特兰蒂斯的火山变得活跃起来，地震、火山爆发陆续发生，亚特兰蒂斯开始出现沉入海底的迹象，看着漫天的火雨、浓烟、飞尘，蚩尤国的人民惊惶失措，许多人收拾行李后在大道上奔跑，一波又一波的人涌向机场、码头，一架架飞机、轮船离开亚特兰蒂斯，有的飞往埃及，有的驶往北极，有的前往美洲，四散逃命……
风伯则带领一支效忠于他的部队与应龙师取得联系，表达全军投降之意，并向应龙师出示了女娲娘娘的密件，原来风伯就是多次给华夏天之九部提供情报的神秘人！一代战神蚩尤与蚩尤国人族女王雨师则拒不投降，选择了与亚特兰蒂斯同沉海底。在亚特兰蒂斯消失在茫茫大海之后，应龙师、海神禺京、夸父、风伯等众人浩浩荡荡地返回华夏大陆，向黄帝复命。
已经白发苍苍的应龙师向黄帝复命之后，向黄帝请求卸甲归田，做一位自由自在的渔樵，黄帝见应龙师已经厌倦了战争，挽留恐怕不容易，于是让应龙师先去找个中意的山川领地好好休息一阵子，放松一下心情，卸甲归田的事以后再说。
应龙师觅得一处山川，在那里居住休憩，看着滚滚长江东逝水，浪花淘尽英雄。感叹是非成败转头空。青山依旧在，几度夕阳红。这位白发渔樵则坐卧在江渚之上，惯看那秋月春风。
全球核战的惨烈战争虽然已经结束，但是更大的灾难却正在一步一步地降临……