就这样，我也被安排在帝丹小学一年级上学。就在这时，学校又来了一名女孩，名叫灰原哀。“小哀，你好，我叫吉田步美，你叫我步美吧！”步美在一旁牵着她的手，说。可灰原却不屑一顾地走向一旁。元太又说:“喂！你怎么可以这样？人家在叫你啊，至少理一下吧！”
可没想到的是，灰原竟然在这时大哭起来。天哪，我最看不了女孩哭了。就像上次小兰和我还上一年级……突然，我发现灰原的抽屉里放着一盒药，额！好像……是琴酒那天让我吃的药！那个令我变小的……药！
她到底是什么来历？我边走在路上边想。“喂，柯南。带着灰原一起走吧，她刚好也走那边！”光彦朝我大叫道。于是，我迫不得已和这个来历不明的女孩走在一起。“在想我是谁吗？呵呵。”灰原突然停下脚步，对我说。
啊！我被吓了一跳。“你究竟是谁？”我终于把心中想说的话说了出来。灰原笑着说:“黑暗组织，宫野志保。”什么！黑暗组织！“那个让我变小的药到底是什么？快告诉我！”我跑过去抓住她的手，问到。“啊，想知道吗？APTX4869，当然是毒药喽！不过好像出了差错，能让人变小哦！”灰原挣脱出我的控制，跑了出去，边跑还边说:“竹笋可不会站着等你哦！”
我陷入了沉思，想着这句话到底什么意思。啊！对了！是“笠”字，阿笠博士！遭了，阿笠博士有危险！我连忙跑到博士家里，冲了进去。“博士！”我大叫道。就在我认为博士被袭击的时候，他突然出现在我的面前。
“那个女孩呢？她是黑暗组织的人啊！”我把这件事告诉了博士，可博士竟然不以为然地说道:“怎么了？她在洗澡啊。”“正好。”我笑着说。“你，你不会要看小哀洗澡吧？”博士惊讶地看着我。“不是，我只是不想让她听见我们的对话。”我紧张地把博士拉到一旁。
经过对话，我知道了原来灰原是背叛了组织后，吃下了药后被博士发现了，于是便把她安顿在自己家中。