从6月上旬开始，在慈禧太后招抚和默许下，直隶各地义和团不分昼夜，日以千计地涌入北京城。原来内城多一街一坛，现很快一街三四坛或五六坛。上至王公卿相，下至贩夫走卒以至娼优隶卒，几乎无人不团，无地不团。时人估算当时北京城中已有半数人为义和团民。6月9日，董福祥部甘军入城，宣称已令义和团做先锋，剿灭洋人，甘军做后应。此时，清廷已默许义和团仇杀教民。6月12日，义和团以“外城姚家井一带教民已先期避入使馆，不得肆其荼毒”为名，“将该处所有教民房屋，尽付之一炬，其彰仪门外西入跑马厅，也一并焚烧”。此为北京义和团焚烧教堂之始。
随后，北京义和团焚烧、捣毁城内及京郊各处教堂、洋楼，外国人开办的医院、商行及教徒住宅等亦被冲击。如崇文门内路东奉真教堂，沟栏胡同两教堂，宣武门大街耶稣堂、天主堂，东堂子胡同施医院，米市西路天主堂所开铺户，四牌楼六条胡同赫德家、日本旧馆，西交民巷教民房屋、海关办公洋房，前门大栅栏老德记西药房等，均被捣毁并付之一炬。“灭尽洋人教民”的反帝激情弥漫全城。至6月下旬，北京城内只剩下了法国天主教在北京最大的教堂——西什库教堂。
义和团在焚毁北京教堂和教民房屋的同时，还对教士、教民予以严惩，以至屠杀。6月13日晚，义和团将崇文门内所有教堂尽皆焚毁，杀教民及其家属二三百人。许多流氓地痞趁机抢劫。不久，董福祥部甘军也群起焚毁教堂和教民房屋，抢其财物。
义和团运动期间，在京各国侵略者不断向义和团挑衅。从6月10日起，由英国中将西摩尔率领的八国联军开始由天津向北京进军。在大沽口外的八国联军也开始蠢蠢欲动，准备攻占天津。这样，中国人民和帝国主义侵略者已经处于实际上的战争状态。
6月17日，八国联军攻占大沽炮台，天津义和团和清军开始围攻紫竹林租界和老龙头火车站。20日，北京义和团也和清军联合，开始围攻东交民巷公使馆和西什库教堂。
6月21日，清廷发布对外宣战诏书，同时另下一谕，招抚并嘉奖义和团。嘉奖义和团的谕旨说道：义和团以血肉之躯，与枪炮相搏，不用国家一兵，不糜国家一饷，执干戈以卫社稷，此皆社稷之福。现先行传旨嘉奖，事定之后，再行加恩。同时谕令官兵与义和团联合，共同抗敌，并令各省督抚“招集义民成团，借御外侮”。22日，清廷发放义和团粮米两万石，随后又发放银10万两给义和团，鼓励义和团保家卫国。
清廷招抚并嘉奖义和团、义和团成为合法团体后，北京义和团也和天津等地义和团一样，与清军联合打击帝国主义，加紧攻打东交民巷公使馆和西什库教堂。成为反抗帝国主义侵略的主要力量。
8月上旬，八国联军由天津向北京进攻，部分北京义和团参加了抗击八国联军侵占北京城的战斗。八国联军占领北京后，义和团遭到八国联军的野蛮屠杀。不久，清廷为了讨好帝国主义，也对义和团实行屠杀政策。在中外反动势力联合剿杀下，轰轰烈烈的义和团反帝爱国运动失败。
廊坊大捷
1900年4、5月间，义和团在京、津地区蓬勃发展，引起列强的极大恐慌。英、法、德、美、俄、日、意、奥等国使馆，在反复要求清政府速速剿灭义和团的同时，纷纷以保护使馆为名，拍电给本国政府，要求调兵来华，镇压义和团运动。随后，列强不断向中国增兵，天津大沽口外一时外国兵舰云集，各国列强耀武扬威。
1900年5月21日，列强驻华11国公使联合要求清政府严禁义和团。清政府虽然发布了“禁拳章程”和“告示”，但又表示对义和团“以晓谕为主，毋轻用兵”。
5月28日，各国列强决定调兵由津入京保护使馆。次日，各国列强开始由大沽向天津派遣海军陆战队。30日，英美法俄四国公使转告总理衙门，各国决定调兵保护使馆，法国驻津总领事杜士兰要求裕禄备车放行。31日黎明，总理衙门致函英美法俄四国公使，允许各国调兵保护使馆，同时电告裕禄：洋兵护馆，准由火车运送，但人数不得过多，致碍邦交。随后，清政府撤走布置在北京车站准备阻击各国军队入京的清军。当晚7时，列强使馆卫队35人，通过京津铁路到达北京。6月1日，50名德军也由天津出发经廊坊抵达北京。6月2日，30名奥军又由天津乘火车经廊坊抵达北京。
各地义和团看到天津洋兵不断乘火车入京，纷纷出动，拆毁京津沿线铁路，阻止侵略军。6月4日，义和团百余人袭击黄村，焚烧安定车站，拆毁杨村铁桥。6月5日，义和团再次出动，袭击焚烧廊坊车站。6月6日，义和团又在落垡砍电线杆，焚烧站房，遭到清军聂士成部的镇压。6月7日、8日，义和团继续在廊坊、落垡地区拆毁铁路，以阻止侵略军进京。同时，各地义和团毁教堂、杀教民的反洋教斗争愈演愈烈。
6月9日，清政府下诏招抚义和团，同时调清军劲旅董福祥部甘军进驻北京天坛，以备不测。同日，北京公使团的英国公使窦纳乐3次打电报给在天津渤海湾的英国海军司令西摩尔，催促他急速率兵进北京，以保护北京公使馆。于是，聚集天津的各国侵略军决定乘火车进京。他们狂妄地认为，只要一小队士兵配备几门大炮，就可以打到北京。
6月10日清晨，由英、法、美、俄、日、德、意、奥组成的西摩尔联军在塘沽登陆，乘火车到达天津。在天津铁路部门拒绝调车的情况下，英、德两国军队首先冲进车库，强行夺取火车机头，以自己的员工驾驶。约上午9时半，第一列满载英、美、奥、意500多名联军的专列火车，轰隆隆地驶出天津，向北京开去。大约上午11时，第二列满载各国侵略军600多人的专列火车，也轰隆隆驶出天津，追随第一辆向北京进军。下午，第三批侵略军也乘火车离津，轰隆隆驶向北京。接着又开出两列支援和补给的火车。这数批侵略军合计2000多人，统帅是英国海军中将西摩尔，副统帅是美国海军上校麦卡加拉。侵略者们估计京津铁路会遭到一定程度的破坏，随车携带了器材，准备边走边修，于傍晚时分开进北京。
上午，廊坊地区义和团闻知西摩尔联军乘火车由天津向北京进军后，立即出动飞骑，往附近各县传递揭帖，并通知铁路沿线的义和团迅速拆毁铁路，破坏电讯，阻止西摩尔联军入京。那些离京津铁路较近的义和团，纷纷出动，开始了阻截西摩尔联军的战斗。
当日中午时分，西摩尔联军行至杨村车站，驻守在这里的清军聂士成部未表示出对侵略军的敌意，侵略军放心大胆地继续前进。但一过杨村车站，就发现铁路已被义和团全部毁坏，无法继续前进，只得下车边修边行，行进速度顿时迟滞下来。当日，义和团还砍断了京津铁路沿线的电线杆，使京津间的电讯联络完全中断。侵略军既不能继续前进，也无法同天津联络，当晚进入北京的计划成为泡影。
6月11日，西摩尔联军的专列驶近京津间的东安县境。当列车开到距离落垡车站约一公里处的大铁桥附近时，又发现铁路被毁，匆匆忙忙下车抢修铁路。这时，埋伏在路南树丛中的东安、霸州、永清、武清等地的义和团约2000多人，在东安县著名首领倪赞清等人率领下，呐喊着冲向西摩尔联军。侵略军的速射炮和机枪立即开火，炮弹在密集的人群中爆炸。义和团伤亡很大，但个个奋勇争先，冲在前面的义和团民与侵略军展开了近距离战斗。
这场战斗持续了约半个时辰，由于侵略军火力凶猛，再加上援军陆续赶来参战，义和团无法继续作战，只得主动撤离。这一仗义和团牺牲60多人，荣营村义和团大师兄王山、岳各庄团总刘项及其子刘成喜、西马圈村大师兄张廷杰、夏营村大师姐郭凤花等，均壮烈牺牲。
当日下午，西摩尔联军进占了落垡，并在车站废墟上修筑了炮台。当日晚，西摩尔率联军一部到达廊坊，且在此修筑了炮台。这样，西摩尔联军在廊坊地区有了廊坊和落垡两个军事据点。
6月13日，清廷发布上谕：命聂士成部全数调回天津附近铁路地区驻扎，以便“实力禁阻”洋兵入京。同日，义和团对西摩尔联军发动第二次进攻，再次遭受巨大伤亡。
6月14日上午9时，义和团攻打被西摩尔联军占据的廊坊车站，伤亡惨重，但5名脱离联军队伍的意大利侵略军也被义和团杀死。当日下午，义和团向西摩尔联军驻守的落垡车站发起进攻。双方战至傍晚，驻扎廊坊的西摩尔联军派兵携带大炮来援。在侵略军的猛烈轰击下，100多名义和团阵亡，被迫撤出战斗。此次战斗，义和团打伤2名英国水兵。
西摩尔联军被困在廊坊、落垡地区已历时5天，粮食眼看就要吃光。他派出一列火车，企图折返天津搬运给养。不料回天津的铁路也早被义和团拆毁，西摩尔联军后路断绝，只好抢粮度日。
从6月10日起，在北京地区义和团的飞笺传帖下，外州县各村镇义和团，不分昼夜，源源不断入援北京，阻击西摩尔联军进京的义和团队伍日益壮大。与此同时，廊坊车站周围村庄的群众不断将“得胜饼”、“得胜汤”送到各地义和团队伍。在战斗中负伤的义和团员，也得到群众和红灯照姐妹们的妥善安置和照顾。
6月15日，西摩尔联军集中主力在廊坊附近抢修铁路。数千名义和团则包围了落垡车站，与盘踞落垡的侵略军展开了激烈的战斗。就在这一天，聚集天津的各国侵略军强占了塘沽，抢占了军粮城、老龙头火车站等地，开始进攻大沽口炮台。清军聂士成部抵津御敌。中国与八国联军的战争事实上已经爆发。
6月16日，清政府劝阻西摩尔联军不要再向北京进军，否则即派董福祥部甘军前往拦阻，如不服，则决战。同时，清廷命令驻天津清军，“此后各国如有续到之兵，应力为阻止，朝廷不再遥制”。第二日，清廷又命令各省督抚迅速拣派队伍，驰赴京师，听候调用。
在不断遭到义和团围攻和给养断绝的情况下，西摩尔联军决定退回杨村，改由运河乘船北上进京。但次日，即6月17日，八国联军攻占了大沽口，京津地区的清军开始投入同八国联军的战争。西摩尔联军所面对的不光是装备大刀长矛原始武器的义和团，还有经过正规训练的清军正规军。
6月18日，清军劲旅董福祥部甘军一部步兵、骑兵共2000多人开抵廊坊，该部由姚旺统领。与此同时，在廊坊地区的各地义和团，也准备同西摩尔联军大战一场。于是，义和团和姚旺统领的董福祥部甘军联合，于上午11时左右，向驻守廊坊但准备撤回杨村的西摩尔联军发起猛烈进攻。董福祥部甘军施放枪炮猛烈射击，吸引住西摩尔联军的主力，骑兵则从右翼包抄，向敌人猛攻。义和团乘势一次又一次地猛冲，有的甚至冲上站台，同敌人展开肉搏战。战斗进行了两三个小时，西摩尔联军支持不住，仓惶逃上火车。义和团和董福祥部甘军追击，敌人开车逃跑。此次战斗，打死打伤西摩尔联军300多人。义和团和董部甘军也遭受重大伤亡。其中义和团死亡500多人，甘军死亡200多人。统领姚旺身负重伤，抬下战场。
战斗结束，董福祥闻讯从北京赶至廊坊，见到一片片阵亡将士的尸体，眼泪禁不住滚滚而下。他悲痛地说：没有估计打这次大仗，一是来人少了，二是没有调炮兵来，如果来了炮兵，使敌人在铁道坡上伏不住，我们也不会有这么大的伤亡。最后，把牺牲官兵的遗体，用大车运到炊庄村，埋葬在该村8亩大的墓地里。群众称为“阵亡清军墓”。
西摩尔联军狼狈地从廊坊逃走，义和团连续作战追击敌人，大队拳民从廊坊一直追到杨村。当晚，义和团和甘军又在杨村车站偷袭敌营，打死打伤敌人近40人。在中国军民联合打击下，西摩尔感到“进京之路，水陆俱穷”，于是决定放弃进犯北京的计划，沿运河向天津后撤。
6月20日清晨，西摩尔联军开始了返回天津的总撤退。他们抢来4只大型民船和2只小木船，用以运送伤员。为了轻装而逃，除随身携带的枪械弹药，其余辎重一律抛弃。沿着运河两岸，美、法、意军队在前开路，英、俄、日、德、奥在后面守护伤兵，急匆匆顺北运河南下。在回撤路上，联军又屡遭义和团袭击，白天不敢行动，只好夜间窜逃。
6月22日，西摩尔联军退回天津，抢占天津西沽武库，遭义和团和清军围攻。西摩尔联军无处安营扎寨，派人向租界求援。26日，天津租界内2000多侵略军前来搭救，西摩尔联军这才狼狈逃回租界。
廊坊一战，从6月10日开始，到6月20日结束，西摩尔联军62人被击毙，320人受伤，伤亡人数约占联军总人数的1／5。不可一世的西摩尔联军，原拟当日抵达北京，不料想在半个月的时间里，都未能如愿。义和团和清军联合抗击西摩尔联军的胜利，狠狠打击了侵略者的嚣张气焰，为中国人民反对帝国主义侵略斗争的历史，谱写了光辉的一页。
清廷四次御前会议
时至1900年6月，义和团和甘军在北京焚烧教堂，公使馆荷枪实弹，如临大敌，联军已从天津进军北京。
如此，清廷更加紧张起来。对义和团是剿是抚，对列强是战是和，清廷已没有多少时间考虑了。因此，从6月起，清廷先后四次召开御前会议，商讨和战问题。